RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, human

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDSPL-208	ENST00000486978	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	ERVK-16	P61578	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	TSPAN5	P62079	268 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	TATDN3	Q17R31	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	C15orf32	Q32M92	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	ISOC1	Q96CN7	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978		H0Y980	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978		M0QYG6	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	TPPP	O94811	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	REG1A	P05451	166 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	CSN3	P07498	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	DEFA4	P12838	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	MYOD1	P15172	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	TBP	P20226	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	LPAR6	P43657	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	UCP3	P55916	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	OR2B8P	P59922	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	KLK9	Q2XQG4	91 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	CADM3	Q8N126	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	PPP5D1	E7EU14	171 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	RGS5	O15539	181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	CYB5B	O43169	146 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	SNAPC5	O75971	98 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	NDUFB8	O95169	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	LY6G6C	O95867	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	KRAS	P01116	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	CD3D	P04234	171 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	IFNA6	P05013	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	RPA2	P15927	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	G6PC	P35575	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	ARL3	P36405	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	SPCS2	Q15005	226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978		Q8N402	240 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	CXorf58	Q96LI9	332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	GABARAP	H6UMI1	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	LGALS9	O00182	355 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	CTDSP2	O14595	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTDSPL-208	ENST00000486978	DEDD	O75618	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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