RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 DBTP11182 482 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF3P17036 446 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 ALOX5APP20292 161 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 GNRHRP30968 328 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 IFNGR2P38484 337 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 TFPI2P48307 235 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 NUDT2P50583 147 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 RIDAP52758 137 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 CYCSP99999 105 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF876PQ49A33 203 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 MORN2Q502X0 79 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM69Q5SWH9 247 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC25A24Q6NUK1 477 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 Q6ZSR3 168 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 SAXO1Q8IYX7 474 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 OR9Q2Q8NGE9 314 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 OR10G7Q8NGN6 311 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM37Q8WXS4 190 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 PP6455Q8WZ26 134 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 PHYHIPQ92561 330 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 LITAFQ99732 161 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 SH3GL1Q99961 368 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 MED20Q9H944 212 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 OR2S2Q9NQN1 319 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 CLEC5AQ9NY25 188 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 TAS2R1Q9NYW7 299 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 BAIAP2Q9UQB8 552 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 ENPP4Q9Y6X5 453 aa2.73□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 AIPO00170 330 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 IGHV3-23P01764 117 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 HBZP02008 142 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 CCL1P22362 96 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 PSMB6P28072 239 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 MAGEA2P43356 314 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 GSSP48637 474 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 DAD1P61803 113 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 PAFAH1B2P68402 229 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
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ECHDC1-211ENST00000460558 TSPAN31Q12999 210 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 P2RY14Q15391 338 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 C6orf183Q5T699 404 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM222AQ5U5X8 452 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 LEMD1Q68G75 181 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF679Q8IYX0 411 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 STX19Q8N4C7 294 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 SUMF2Q8NBJ7 301 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa2.72□□□□□ -1.97
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ECHDC1-211ENST00000460558 GIMAP1Q8WWP7 306 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 C10orf35Q96D05 121 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 OPALINQ96PE5 141 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 OR2A7Q96R45 310 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 OR51V1Q9H2C8 321 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 GORASP2Q9H8Y8 452 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 IL20Q9NYY1 176 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 PIPOXQ9P0Z9 390 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 EXTL2Q9UBQ6 330 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 OR52A1Q9UKL2 312 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 IKZF2Q9UKS7 526 aa2.72□□□□□ -1.97
ECHDC1-211ENST00000460558 TNXBP22105 4242 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A0A6YYD4 124 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 SMIM9A6NGZ8 99 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 RAB29O14966 203 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 SCGB2A1O75556 95 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 APOA2P02652 100 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 IGKV1-16P04430 117 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 CT45A6P0DMU7 189 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 CT45A5P0DMU8 189 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 CT45A7P0DMV0 189 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 ATF1P18846 271 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 FCGR2CP31995 323 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 ALDH3B2P48448 385 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 SMIM11AP58511 58 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 DEFB131AP59861 70 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 ACTR3P61158 418 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 ERVK-16P61578 105 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 GNMTQ14749 295 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 NXNL2Q5VZ03 156 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 ELP2Q6IA86 826 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 PLET1Q6UQ28 207 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF497Q6ZNH5 498 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC25A42Q86VD7 318 aa2.71□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 OR2T33Q8NG76 320 aa2.71□□□□□ -1.98
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