RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390397.2

TRBV24-1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 24-1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV24-1, Length 381 nt, Biotype TR V gene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV24-1-201ENST00000390397 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 Q9N2K0 584 aa3.36□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 ZNF586Q9NXT0 402 aa3.36□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 THYN1Q9P016 225 aa3.36□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 RFNGQ9Y644 331 aa3.36□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 IGLC7A0M8Q6 106 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 H3BMM0 161 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 RAB27BO00194 218 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 DCTN3O75935 186 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 CD2P06729 351 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 DAD1P61803 113 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 PPP3R1P63098 170 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 ARFRP1Q13795 201 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 TMEM69Q5SWH9 247 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 DHFR2Q86XF0 187 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 DEFB107AQ8IZN7 70 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 SYS1Q8N2H4 156 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 CBR4Q8N4T8 237 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 ZBTB34Q8NCN2 500 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 OR8J1Q8NGP2 316 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 SETD6Q8TBK2 473 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 CANT1Q8WVQ1 401 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 ST8SIA2Q92186 375 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 RFKQ969G6 155 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 RAB24Q969Q5 203 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 NRBF2Q96F24 287 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 GRAMD2BQ96HH9 432 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 ADTRPQ96IZ2 230 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 UHRF2Q96PU4 802 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 UPK3BQ9BT76 320 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 OR2D2Q9H210 308 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 C21orf62Q9NYP8 219 aa3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 TRDCB7Z8K6 153 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 K7EIM0 57 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 ST8SIA3O43173 380 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 FCGR3BO75015 233 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 KBTBD11O94819 623 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 YIF1AO95070 293 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 GAS8-AS1O95177 125 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 ZNF688P0C7X2 276 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 GNB3P16520 340 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 GNRHRP30968 328 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 ALDH3B2P48448 385 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 TMEM50BP56557 158 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 LINC00310P59036 64 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 ERVFC1-1P60608 527 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 RPL30P62888 115 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 RPL8P62917 257 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 HLA-DRB3P79483 266 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 IGSF11Q5DX21 431 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 OR2G6Q5TZ20 316 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 KDM4DQ6B0I6 523 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 OR10K2Q6IF99 312 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 SLC25A24Q6NUK1 477 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 MOB1BQ7L9L4 216 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 JAGN1Q8N5M9 183 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 OR10W1Q8NGF6 305 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 DCANP1Q8TF63 244 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 LGALS12Q96DT0 336 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 TM2D1Q9BX74 207 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 MAGT1Q9H0U3 335 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 RABAC1Q9UI14 185 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 AK3Q9UIJ7 227 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 MGAT4AQ9UM21 535 aa3.34□□□□□ -1.87
TRBV24-1-201ENST00000390397 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa3.33□□□□□ -1.88
TRBV24-1-201ENST00000390397 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa3.33□□□□□ -1.88
TRBV24-1-201ENST00000390397 A0A0A6YYD4 124 aa3.33□□□□□ -1.88
TRBV24-1-201ENST00000390397 TRAV3A0A0B4J244 114 aa3.33□□□□□ -1.88
TRBV24-1-201ENST00000390397 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa3.33□□□□□ -1.88
TRBV24-1-201ENST00000390397 A0A1W2PPK0 400 aa3.33□□□□□ -1.88
TRBV24-1-201ENST00000390397 NPIPB6E9PJ23 425 aa3.33□□□□□ -1.88
TRBV24-1-201ENST00000390397 F5H768 121 aa3.33□□□□□ -1.88
TRBV24-1-201ENST00000390397 SOCS1O15524 211 aa3.33□□□□□ -1.88
TRBV24-1-201ENST00000390397 OGG1O15527 345 aa3.33□□□□□ -1.88
TRBV24-1-201ENST00000390397 IGLV2-14P01704 120 aa3.33□□□□□ -1.88
TRBV24-1-201ENST00000390397 C1QBP02746 253 aa3.33□□□□□ -1.88
TRBV24-1-201ENST00000390397 SERPINE2P07093 398 aa3.33□□□□□ -1.88
TRBV24-1-201ENST00000390397 CD37P11049 281 aa3.33□□□□□ -1.88
TRBV24-1-201ENST00000390397 HLA-GP17693 338 aa3.33□□□□□ -1.88
TRBV24-1-201ENST00000390397 SRMP19623 302 aa3.33□□□□□ -1.88
TRBV24-1-201ENST00000390397 CELP19835 753 aa3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms