RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PRAME-212ENST00000485532 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PRAME-212ENST00000485532 IGKV1-16P04430 117 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-212ENST00000485532 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PRAME-212ENST00000485532 MECP2P51608 486 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PRAME-212ENST00000485532 RND3P61587 244 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-212ENST00000485532 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PRAME-212ENST00000485532 PSG5Q15238 335 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-212ENST00000485532 ACSM6Q6P461 480 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-212ENST00000485532 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-212ENST00000485532 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-212ENST00000485532 BVESQ8NE79 360 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-212ENST00000485532 LFNGQ8NES3 379 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-212ENST00000485532 OR5AN1Q8NGI8 311 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-212ENST00000485532 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PRAME-212ENST00000485532 GPHA2Q96T91 129 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-212ENST00000485532 SLC2A9Q9NRM0 540 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-212ENST00000485532 SDHAF2Q9NX18 166 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-212ENST00000485532 ZNF221Q9UK13 617 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-212ENST00000485532 WASHC3Q9Y3C0 194 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-212ENST00000485532 A0A0B4J293 547 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 SLC22A5O76082 557 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 CA2P00918 260 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 GP9P14770 177 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 PIGPP57054 158 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 TPPP2P59282 170 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZNX1 250 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 ZNF383Q8NA42 475 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 ZBTB34Q8NCN2 500 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 RCHY1Q96PM5 261 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 TENM2Q9NT68 2774 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 C3orf84H3BNL1 204 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 TNFSF12O43508 249 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 IL5P05113 134 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 AKR1C4P17516 323 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 MC5RP33032 325 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 TAS2R31P59538 309 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 RPS16P62249 146 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 DEFA5Q01523 94 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 DHODHQ02127 395 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R1AQ13522 171 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 CMTM1Q8IZ96 169 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 GRPEL2Q8TAA5 225 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 SEC22CQ9BRL7 303 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 NAA60Q9H7X0 242 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 M0R1X1 148 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 MPPED1O15442 326 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 SLC25A17O43808 307 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 TRGV3P03979 118 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 OR4E1P0C645 316 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 DUTP33316 252 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 RPL30P62888 115 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 PJVKQ0ZLH3 352 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 AKIRIN2Q53H80 203 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 TMEM128Q5BJH2 165 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 CASC10Q5T4H9 136 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 ZNF562Q6V9R5 426 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 TBC1D26Q86UD7 250 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 OR5T1Q8NG75 326 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 MUC7Q8TAX7 377 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 RHOVQ96L33 236 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 GHITMQ9H3K2 345 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 C7orf66A4D0T2 115 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD34BA5PLL1 514 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 LINC00473A8K010 186 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 PRAF2O60831 178 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 DHFRP00374 187 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 F2RP25116 425 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 DHRS2Q13268 280 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 FXYD3Q14802 87 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 TATDN3Q17R31 274 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 ZNF66Q6ZN08 573 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 LYG2Q86SG7 212 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 OR52B4Q8NGK2 314 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 OR51H1Q8NH63 302 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 OR4C12Q96R67 309 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 ALG5Q9Y673 324 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 A0A1B0GVG6 124 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 C9orf170A2RU37 121 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 SFT2D2O95562 160 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 IGLV2-23P01705 113 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 VAMP1P23763 118 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 S100GP29377 79 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-212ENST00000485532 BRWD1-AS2P59051 145 aa9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.8 ms