RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		8.81	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	8.81	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	THYN1	Q9P016	225 aa		8.81	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		8.81	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	VWF	P04275	2813 aa		8.81	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	NOTCH1	P46531	2555 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	SNAPC5	O75971	98 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	BRI3	O95415	125 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	SMIM18	P0DKX4	95 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	HRH1	P35367	487 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	RFX2	P48378	723 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP5G2	Q06055	141 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	SSX9	Q7RTT3	188 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	GPX8	Q8TED1	209 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	C5orf30	Q96GV9	206 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	BET1L	Q9NYM9	111 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	COMMD9	Q9P000	198 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	SCOC	Q9UIL1	159 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		8.8	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	SOX15	O60248	233 aa		8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	ATG12	O94817	140 aa		8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	APELA	P0DMC3	54 aa		8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	HLA-G	P17693	338 aa		8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	NAT1	P18440	290 aa		8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	ELK1	P19419	428 aa		8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	TBP	P20226	339 aa		8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	TMBIM6	P55061	237 aa		8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	CD69	Q07108	199 aa		8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	CTF1	Q16619	201 aa		8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	RPEL1	Q2QD12	228 aa		8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	DCUN1D4	Q92564	292 aa		8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	TSC22D3	Q99576	134 aa		8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	PEMT	Q9UBM1	199 aa		8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		8.79	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		8.78	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A087WW49	117 aa		8.78	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		8.78	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC160	A6NGH7	325 aa		8.78	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	IGLV2-14	P01704	120 aa		8.78	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	RLN1	P04808	185 aa		8.78	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	PGAM2	P15259	253 aa		8.78	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	F2R	P25116	425 aa		8.78	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	SLURP1	P55000	103 aa		8.78	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	TAS2R19	P59542	299 aa		8.78	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	8.78	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	8.78	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		8.78	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		8.78	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	NECAP1	Q8NC96	275 aa		8.78	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		8.78	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	8.78	□□□□□ -1
TTLL3-231	ENST00000496246	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	SERPINE2	P07093	398 aa		8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	FGF2	P09038	288 aa		8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	GNRHR	P30968	328 aa		8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	ALDH3B2	P48448	385 aa		8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	RHOG	P84095	191 aa		8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	IL18	Q14116	193 aa		8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	OR4A47	Q6IF82	309 aa		8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	8.77	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	MARCH11	A6NNE9	402 aa		8.76	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		8.76	□□□□□ -1.01
TTLL3-231	ENST00000496246	DISC1	C4P0D8	188 aa		8.76	□□□□□ -1.01

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