RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 EDN2P20800 178 aa8.11□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 RHOGP84095 191 aa8.11□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 TMEM69Q5SWH9 247 aa8.11□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 ZNF343Q6P1L6 599 aa8.11□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 IL34Q6ZMJ4 242 aa8.11□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 ZNF66Q6ZN08 573 aa8.11□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 MMD2Q8IY49 270 aa8.11□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 OR5AP2Q8NGF4 316 aa8.11□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 OR51H1Q8NH63 302 aa8.11□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 OR4S2Q8NH73 311 aa8.11□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 TMEM68Q96MH6 324 aa8.11□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 OR2A7Q96R45 310 aa8.11□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 OR4C12Q96R67 309 aa8.11□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 EHFQ9NZC4 300 aa8.11□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 COMMD3Q9UBI1 195 aa8.11□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.11□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 SMIM18P0DKX4 95 aa8.1□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 ZP3P21754 424 aa8.1□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.1□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 SPAG16Q8N0X2 631 aa8.1□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.1□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.1□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.1□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.1□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.1□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.1□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 A6NJY4 79 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 PPP5D1E7EU14 171 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 BMPR1BO00238 502 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 HPGDSO60760 199 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 S1PR2O95136 353 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 BRI3O95415 125 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 IGLV1-51P01701 117 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 CSN3P07498 182 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 HLA-DMAP28067 261 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 GNRHRP30968 328 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 CBX5P45973 191 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 ATP5G2Q06055 141 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 AADACL3Q5VUY0 350 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 OR4A47Q6IF82 309 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 CROCCP3Q8IVE0 287 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 USMG5Q96IX5 58 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 SPIN2AQ99865 258 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 ELOVL1Q9BW60 279 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 FXYD6Q9H0Q3 95 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 HRASLSQ9HDD0 168 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 ANAPC10Q9UM13 185 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 U3KQK5 164 aa8.09□□□□□ -1.11
NELFE-213ENST00000494956 NDUFB8O95169 186 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 HRASP01112 189 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 RLN1P04808 185 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 ZNF735P0CB33 412 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 ELK1P19419 428 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 PRSS3P35030 304 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 HRH1P35367 487 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 HERV-K104P61576 105 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 RPEL1Q2QD12 228 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 C15orf32Q32M92 178 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 Q8N1Y9 231 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 OR5H2Q8NGV7 314 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 VSTM2AQ8TAG5 236 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 SLC2A9Q9NRM0 540 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 DMRT1Q9Y5R6 373 aa8.08□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 DPPA5A6NC42 116 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 FAM223BA6NKX1 122 aa8.07□□□□□ -1.12
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NELFE-213ENST00000494956 TMEM127O75204 238 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 OR2C1O95371 312 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 NAT1P18440 290 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 KIR2DS2P43631 304 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 OR2B8PP59922 312 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 RPL8P62917 257 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 CTF1Q16619 201 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 DHRS11Q6UWP2 260 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.07□□□□□ -1.12
NELFE-213ENST00000494956 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.07□□□□□ -1.12
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