RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582821.5

GGA3-215, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-215	ENST00000582821	KIR2DS2	P43631	304 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	RFX2	P48378	723 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	TMBIM6	P55061	237 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	OR4S2	Q8NH73	311 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	GNB4	Q9HAV0	340 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	EHF	Q9NZC4	300 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		10.85	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	PMP2	P02689	132 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	GNRHR	P30968	328 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	SPCS2	Q15005	226 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	DEFB136	Q30KP8	78 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	OR11H1	Q8NG94	326 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	MOB3A	Q96BX8	217 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	DUX3	Q96PT4	197 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	SORL1	Q92673	2214 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GGA3-215	ENST00000582821	FAM25A	B3EWG3	89 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	FAM25C	B3EWG5	89 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	FAM25G	B3EWG6	89 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	HRAS	P01112	189 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	RCVRN	P35243	200 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	FXYD4	P59646	89 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	HERV-K104	P61576	105 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	GNB1	P62873	340 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	CATR1	Q13166	79 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	MMD2	Q8IY49	270 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	POC5	Q8NA72	575 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	RHOV	Q96L33	236 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	MSGN1	A6NI15	193 aa		10.82	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	OR2A4	O95047	310 aa		10.82	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	OR8U8	P0C7N1	319 aa		10.82	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	HLA-DMA	P28067	261 aa		10.82	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	HRH1	P35367	487 aa		10.82	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF616	Q08AN1	781 aa		10.82	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		10.82	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		10.82	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM17	Q86X19	198 aa		10.82	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	OR5T1	Q8NG75	326 aa		10.82	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		10.82	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		10.82	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		10.82	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	OR2A7	Q96R45	310 aa		10.82	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	GPHA2	Q96T91	129 aa		10.82	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		10.82	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	CTDSP2	O14595	271 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	TNFSF12	O43508	249 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	ACTL6B	O94805	426 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	KBTBD11	O94819	623 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	HPRT1	P00492	218 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	TRGV3	P03979	118 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	MAS1L	P35410	378 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	TNXA	Q16473	311 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	POU2AF1	Q16633	256 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	MS4A10	Q96PG2	267 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	ABHD1	Q96SE0	405 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	SPIN2A	Q99865	258 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	BET1L	Q9NYM9	111 aa		10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821		A0A0G2JLM5	398 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	RAMP3	O60896	148 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	UCP3	P55916	312 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	TPPP2	P59282	170 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	TAS2R31	P59538	309 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	TSPAN5	P62079	268 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	CADM3	Q8N126	398 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-215	ENST00000582821	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		10.8	□□□□□ -0.68

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