RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517139.1

RNU6-1314P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1314, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1314P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1314P-201ENST00000517139 LRRC6Q86X45 466 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 YIPF3Q9GZM5 350 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 NIT2Q9NQR4 276 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 PLAC8Q9NZF1 115 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 EMC3Q9P0I2 261 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 ABCC12Q96J65 1359 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 IRGMA1A4Y4 181 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 C9JCJ5 164 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 TRAPPC2LH3BP13 241 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 COPEO14579 308 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 NQO2P16083 231 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 PTNP21246 168 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 TMEM33P57088 247 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 FAM27BQ5VT28 67 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 MITD1Q8WV92 249 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 ACOT12Q8WYK0 555 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 NUP160Q12769 1436 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 TNCP24821 2201 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 KIF24Q5T7B8 1368 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 A0A1B0GW15 77 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 H0YC42 278 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 GOLGA8RI6L899 631 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 SHBGP04278 402 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 LIMS3P0CW19 117 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 LIMS4P0CW20 117 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 PTMSP20962 102 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 MSNP26038 577 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 ZNF345Q14585 488 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 EXOC3L4Q17RC7 722 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 Q8WTZ3 238 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 TLCD1Q96CP7 247 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 FAM210AQ96ND0 272 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 PTPRSQ13332 1948 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-1314P-201ENST00000517139 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 CHD5Q8TDI0 1954 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 F5H5K5 113 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 PMP2P02689 132 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 CCL5P13501 91 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 ZNF846Q147U1 533 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 NDUFA5Q16718 116 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 TMEM249Q2WGJ8 235 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 GPHB5Q86YW7 130 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 Q8N814 137 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 TMEM239Q8WW34 195 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 LRRC45Q96CN5 670 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 LRRC39Q96DD0 335 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 TMEM56Q96MV1 263 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 TMEM70Q9BUB7 260 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 CD300AQ9UGN4 299 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 RAB19A4D1S5 217 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 F8A1P23610 371 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 GDF5OSQ5U4N7 250 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 SPATA24Q86W54 205 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 PATE1Q8WXA2 126 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 SMIM12Q96EX1 92 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 SIPA1L1O43166 1804 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 CLDN25C9JDP6 229 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 MSMBP08118 114 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 CFL1P23528 166 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 LCA10Q71F78 164 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 ZNF676Q8N7Q3 588 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 TMEM208Q9BTX3 173 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 RAB1BQ9H0U4 201 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 KLK9Q9UKQ9 250 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 BAIAP2Q9UQB8 552 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 TIMM22Q9Y584 194 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 GREB1Q4ZG55 1949 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 C21orf140B9A014 251 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 OTCP00480 354 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 HLA-DQB2P05538 268 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 SLCO1A2P46721 670 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 H2BFSP57053 126 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 RAB8AP61006 207 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 GNA13Q14344 377 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 SGMS2Q8NHU3 365 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 RAB2BQ8WUD1 216 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-1314P-201ENST00000517139 ENPP5Q9UJA9 477 aa-0.38□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms