RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		6.57	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		6.57	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	LAX1	Q8IWV1	398 aa		6.57	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		6.57	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	TEX45	Q8NA69	505 aa		6.57	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	BVES	Q8NE79	360 aa		6.57	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	OR4S2	Q8NH73	311 aa		6.57	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		6.57	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		6.57	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		6.57	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	TMEM68	Q96MH6	324 aa		6.57	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		6.57	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		6.57	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		6.57	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		6.57	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	SHOX	O15266	292 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	ATP6V0E1	O15342	81 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	BRI3	O95415	125 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	UCP3	P55916	312 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	CX3CL1	P78423	397 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	NDP	Q00604	133 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	CADM3	Q8N126	398 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	FBXL15	Q9H469	300 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		6.56	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	LINC01548	A6NM66	108 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128		H3BUA1	57 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	CTDSP2	O14595	271 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	SLC25A17	O43808	307 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	CRYZL1	O95825	349 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	CA2	P00918	260 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	CD74	P04233	296 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	S100G	P29377	79 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	GNRHR	P30968	328 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	RFX2	P48378	723 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	LINC00205	P59089	165 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	TAS2R31	P59538	309 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	TAS2R19	P59542	299 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	POU2AF1	Q16633	256 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	ZNF329	Q86UD4	541 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	TMEM17	Q86X19	198 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	OR52I2	Q8NH67	350 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	ARPC1A	Q92747	370 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	ABHD1	Q96SE0	405 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	PARP11	Q9NR21	331 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	COMMD9	Q9P000	198 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		6.55	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		6.54	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		6.54	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	GPR31	O00270	319 aa		6.54	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	FCGR3B	O75015	233 aa		6.54	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	HPRT1	P00492	218 aa		6.54	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	HRAS	P01112	189 aa		6.54	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	PMP2	P02689	132 aa		6.54	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	PF4V1	P10720	104 aa		6.54	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	6.54	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	HLA-DMA	P28067	261 aa		6.54	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	MAS1L	P35410	378 aa		6.54	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	ECI1	P42126	302 aa		6.54	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		6.54	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	TSPAN5	P62079	268 aa		6.54	□□□□□ -1.36
USP34-208	ENST00000467128	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36

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