RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 C12orf77C9JDV5 145 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 H3BUX3 64 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 IGHV4-59P01825 116 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 MT-ND4P03905 459 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 TFAP2AP05549 437 aa3.47□□□□□ -1.85
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PTPRK-209ENST00000415046 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
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PTPRK-209ENST00000415046 FAM189A2Q15884 450 aa3.47□□□□□ -1.85
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PTPRK-209ENST00000415046 SFXN4Q6P4A7 337 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 GPR141Q7Z602 305 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa3.47□□□□□ -1.85
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PTPRK-209ENST00000415046 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 DYNAPQ8N1N2 210 aa3.47□□□□□ -1.85
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PTPRK-209ENST00000415046 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 ZDHHC22Q8N966 263 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 OR56B1Q8NGI3 324 aa3.47□□□□□ -1.85
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PTPRK-209ENST00000415046 OR13F1Q8NGS4 319 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 OR13D1Q8NGV5 346 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 OR5H6Q8NGV6 325 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 OR1L1Q8NH94 360 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 NDNFQ8TB73 568 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 MAFIPQ8WZ33 124 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 TNFRSF14Q92956 283 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 ARL11Q969Q4 196 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 MOB3AQ96BX8 217 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 RAB3CQ96E17 227 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 TM2D1Q9BX74 207 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 PECRQ9BY49 303 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 SLA2Q9H6Q3 261 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-209ENST00000415046 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa3.47□□□□□ -1.85
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PTPRK-209ENST00000415046 TAS2R3Q9NYW6 316 aa3.47□□□□□ -1.85
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PTPRK-209ENST00000415046 AK3Q9UIJ7 227 aa3.47□□□□□ -1.85
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PTPRK-209ENST00000415046 CCDC160A6NGH7 325 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRK-209ENST00000415046 H7C423 109 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRK-209ENST00000415046 CTDSPLO15194 276 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRK-209ENST00000415046 NOL3O60936 208 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
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PTPRK-209ENST00000415046 FCER2P06734 321 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 CD3GP09693 182 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 SPP1P10451 314 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 CD37P11049 281 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRK-209ENST00000415046 TMEM50BP56557 158 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 UBA52P62987 128 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 GNMTQ14749 295 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 SPCS2Q15005 226 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 SLC9A3R2Q15599 337 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 SSX2Q16385 188 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 AARDQ4LEZ3 155 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 C6orf183Q5T699 404 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 OR52W1Q6IF63 320 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 ETFRF1Q6IPR1 90 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-209ENST00000415046 PRR27Q6MZM9 219 aa3.46□□□□□ -1.86
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