RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 GNB1LQ9BYB4 327 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 OR2D2Q9H210 308 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 NPVFQ9HCQ7 196 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 ELOVL5Q9NYP7 299 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 RFNGQ9Y644 331 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 UNC13CQ8NB66 2214 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 SZT2Q5T011 3432 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 FNDC10F2Z333 226 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 TNFSF15O95150 251 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 NDUFB4O95168 129 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 TIAF1O95411 115 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 OR2H2O95918 312 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 RPL15P61313 204 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 ARL16Q0P5N6 197 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 SSPNQ14714 243 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 ZNF146Q15072 292 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 SMIM21Q3B7S5 101 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 C17orf78Q8N4C9 275 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 OR5B3Q8NH48 314 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 POM121L2Q96KW2 1035 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 EXPH5Q8NEV8 1989 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 ODAMA1E959 279 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 IFNL4K9M1U5 179 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 HAND1O96004 215 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 OTX2P32243 289 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 GPR12P47775 334 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 COMPP49747 757 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 ZNF585BQ52M93 769 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 DCAF12Q5T6F0 453 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 Q6ZRM9 215 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 IFI44Q8TCB0 444 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 ZNF581Q9P0T4 197 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 OR1A1Q9P1Q5 309 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 WNT16Q9UBV4 365 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa5.45□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 CER1O95813 267 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 STAG3L2P0CL84 134 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 RAB7AP51149 207 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 TMEM30BQ3MIR4 351 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 RASL11AQ6T310 242 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 HAPLN4Q86UW8 402 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 TMEM190Q8WZ59 177 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 HSPB9Q9BQS6 159 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 SLC35D1Q9NTN3 355 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 SHANK1Q9Y566 2161 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 PCNX3Q9H6A9 2034 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 A0A1W2PQM1 296 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 ITGB1BP1O14713 200 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 CDIPTO14735 213 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 EREGO14944 169 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 ZNF253O75346 499 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 AREGP15514 252 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 GZMHP20718 246 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 ANOS1P23352 680 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 GNG4P50150 75 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 Q6P435 159 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 CLN8Q9UBY8 286 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 IGKV1-39P01597 117 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 APOA2P02652 100 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 IGKV1D-39P04432 117 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 OR4A8P0C604 315 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 CA6P23280 308 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 G6PCP35575 357 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 TIMP3P35625 211 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 UBE2G2P60604 165 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 NHLH1Q02575 133 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 CLEC12BQ2HXU8 276 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 TEX38Q6PEX7 206 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 PQLC2Q6ZP29 291 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 LRP11Q86VZ4 500 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 BATF2Q8N1L9 274 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 OR1K1Q8NGR3 316 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 PRR7Q8TB68 274 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 ABHD3Q8WU67 409 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 SLC35E1Q96K37 410 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 TMEM208Q9BTX3 173 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 OR2J1Q9GZK6 312 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 CXXC4Q9H2H0 198 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 OSTCQ9NRP0 149 aa5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 A0A096LPE4 126 aa5.43□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 A0A1W2PPZ6 126 aa5.43□□□□□ -1.54
LMO3-202ENST00000320122 SNURFLB1AK76 121 aa5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms