RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516539.1

RNU6-1256P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1256, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1256P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FAM221AA4D161 298 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SLC35F4A4IF30 521 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CCDC85CA6NKD9 419 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 AXIN1O15169 862 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TLR3O15455 904 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PDPK1O15530 556 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CILPO75339 1184 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PAGE1O75459 146 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RGS20O76081 388 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 B3GALT4O96024 378 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 THBS1P07996 1170 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PTPRAP18433 802 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CD33P20138 364 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FGFR3P22607 806 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CHMP4BP1P59074 171 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PCDH1Q08174 1060 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MMRN1Q13201 1228 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FXNQ16595 210 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ARSHQ5FYA8 562 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FBXW10Q5XX13 1052 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 HOMER1Q86YM7 354 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SULF2Q8IWU5 870 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 APPBP2Q92624 585 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ABHD17AQ96GS6 310 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 HHIPQ96QV1 700 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 DNAJC6O75061 913 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TRPA1O75762 1119 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 DGAT1O75907 488 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TRIM37O94972 964 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ATP11AP98196 1134 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PTSQ03393 145 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FOXR1Q6PIV2 292 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MICALL1Q8N3F8 863 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SH3TC2Q8TF17 1288 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 GAL3ST3Q96A11 431 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 GPATCH3Q96I76 525 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MUC3BQ9H195 1237 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SPC25Q9HBM1 224 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FAM221BA6H8Z2 402 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SIN3BO75182 1162 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CASP7P55210 303 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CABP4P57796 275 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 AP3B2Q13367 1082 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SEPT6Q14141 434 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PKDCCQ504Y2 493 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CEP135Q66GS9 1140 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 GK5Q6ZS86 529 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CCDC155Q8N6L0 562 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FAM169BQ8N8A8 192 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FBXO27Q8NI29 283 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CBX8Q9HC52 389 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 BRMS1Q9HCU9 246 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FANCLQ9NW38 375 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TMEM260Q9NX78 707 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PRR12Q9ULL5 1215 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SOX13Q9UN79 622 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SLC12A7Q9Y666 1083 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 J3QW42 95 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RAB11FIP3O75154 756 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ATE1O95260 518 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 BMP6P22004 513 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ARNTP27540 789 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MLECQ14165 292 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 DBN1Q16643 649 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MTERF2Q49AM1 385 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 C2orf27AQ580R0 203 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SYNPOQ8N3V7 929 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TNFRSF25Q93038 417 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 KIFC2Q96AC6 838 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PLD4Q96BZ4 506 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 DNAJC7Q99615 494 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FEZ1Q99689 392 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ADAM19Q9H013 955 aa4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms