RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 DLGAP5Q15398 846 aa40.24■■■■■ 4.03
CHKB-210ENST00000484266 CNTROBQ8N137 903 aa40.24■■■■■ 4.03
CHKB-210ENST00000484266 ABCF2Q9UG63 623 aa40.24■■■■■ 4.03
CHKB-210ENST00000484266 MAST3O60307 1309 aa40.23■■■■■ 4.03
CHKB-210ENST00000484266 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
CHKB-210ENST00000484266 SMC5Q8IY18 1101 aa40.23■■■■■ 4.03
CHKB-210ENST00000484266 CRKP46108 304 aa40.22■■■■■ 4.03
CHKB-210ENST00000484266 GGA3Q9NZ52 723 aa40.22■■■■■ 4.03
CHKB-210ENST00000484266 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
CHKB-210ENST00000484266 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa40.21■■■■■ 4.03
CHKB-210ENST00000484266 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
CHKB-210ENST00000484266 SPDYE2BA6NHP3 402 aa40.2■■■■■ 4.03
CHKB-210ENST00000484266 SPDYE6P0CI01 402 aa40.2■■■■■ 4.03
CHKB-210ENST00000484266 ZAP70P43403 619 aa40.2■■■■■ 4.03
CHKB-210ENST00000484266 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP40.2■■■■■ 4.03
CHKB-210ENST00000484266 MRIQ9BWK5 157 aa40.2■■■■■ 4.03
CHKB-210ENST00000484266 ANKRD45Q5TZF3 282 aa40.19■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 TEKT1Q969V4 418 aa40.19■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 MYH2Q9UKX2 1941 aa40.18■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP40.17■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 ERICH6Q7L0X2 663 aa40.16■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa40.16■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 AOX1Q06278 1338 aa40.16■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa40.16■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 DIXDC1Q155Q3 683 aa40.16■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 HHIPL2Q6UWX4 724 aa40.16■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 PASKQ96RG2 1323 aa40.16■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 CDC37L1Q7L3B6 337 aa40.15■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 ZDHHC15Q96MV8 337 aa40.15■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 MAST2Q6P0Q8 1798 aa40.14■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 ATP5JP18859 108 aa40.14■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 DOCK2Q92608 1830 aa40.14■■■■■ 4.02
CHKB-210ENST00000484266 MECOMQ03112 1051 aa40.12■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 KRT26Q7Z3Y9 468 aa40.12■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 ECHDC1Q9NTX5 307 aa40.12■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 LRP2BPQ9P2M1 347 aa40.12■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 TRAF5O00463 557 aa40.11■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 MYO1BO43795 1136 aa40.11■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 USP48Q86UV5 1035 aa40.11■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 ZNF384Q8TF68 577 aa40.11■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa40.11■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa40.1■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 SULF1Q8IWU6 871 aa40.1■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 BOLA2Q9H3K6 86 aa40.1■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 ANTXR1Q9H6X2 564 aa40.1■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 RAI14Q9P0K7 980 aa40.1■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 TRPM7Q96QT4 1865 aa40.1■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 ADM5C9JUS6 153 aa40.09■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP40.09■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 CLRN2A0PK11 232 aa40.08■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 GPATCH3Q96I76 525 aa40.08■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 GAKO14976 1311 aa40.08■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 SALL3Q9BXA9 1300 aa40.08■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 SPDYE2Q495Y8 402 aa40.08■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 DLK2Q6UY11 383 aa40.08■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
CHKB-210ENST00000484266 TSHZ3Q63HK5 1081 aa40.07■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 HAUS7Q99871 368 aa40.07■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 NUCB1Q02818 461 aa40.06■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 SLF2Q8IX21 1173 aa40.06■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 LNPKQ9C0E8 428 aa40.06■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 NEFLP07196 543 aa40.05■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 HSPA6P17066 643 aa40.05■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 TTC41PQ6P2S7 1318 aa40.04■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 CHD1LQ86WJ1 897 aa40.04■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 VEZTQ9HBM0 779 aa40.04■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa40.04■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 GOLIM4O00461 696 aa40.03■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 IGSF3O75054 1194 aa40.03■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 MX1P20591 662 aa40.03■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 APLP1P51693 650 aa40.03■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 GSTO1P78417 241 aa40.03■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 IDH1O75874 414 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 PAG1Q9NWQ8 432 aa40.01■■■■■ 4
CHKB-210ENST00000484266 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP40■■■■□ 3.99
CHKB-210ENST00000484266 LDHCP07864 332 aa39.99■■■■□ 3.99
CHKB-210ENST00000484266 PI4K2BQ8TCG2 481 aa39.99■■■■□ 3.99
CHKB-210ENST00000484266 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa39.99■■■■□ 3.99
CHKB-210ENST00000484266 MAP3K12Q12852 859 aa39.98■■■■□ 3.99
CHKB-210ENST00000484266 CDCA5Q96FF9 252 aa39.98■■■■□ 3.99
CHKB-210ENST00000484266 DEFB129Q9H1M3 183 aa39.98■■■■□ 3.99
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