RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375429.7

NELFE-202, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NELFE, Length 1,584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-202ENST00000375429 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.597e-9■■■■□ 20.6
NELFE-202ENST00000375429 PDE6AP16499 860 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-202ENST00000375429 ADD2P35612 726 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-202ENST00000375429 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-202ENST00000375429 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
NELFE-202ENST00000375429 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 GPC2Q8N158 579 aa24.95■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 MYH2Q9UKX2 1941 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 IGSF3O75054 1194 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 CHMLP26374 656 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 SCNN1DP51172 638 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 TICAM2Q86XR7 235 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 MAST2Q6P0Q8 1798 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 UBE3CQ15386 1083 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 CYP7A1P22680 504 aa24.92■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 ADGRA1Q86SQ6 560 aa24.92■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 MAST3O60307 1309 aa24.91■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 CDC45O75419 566 aa24.91■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 USP17L8P0C7I0 530 aa24.91■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.91■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 DPF2Q92785 391 aa24.91■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 FAM227BQ96M60 508 aa24.91■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 SHTN1A0MZ66 631 aa24.9■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 HIP1O00291 1037 aa24.9■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 GSTO1P78417 241 aa24.9■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.9■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 MRIQ9BWK5 157 aa24.9■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.9■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 APPBP2Q92624 585 aa24.89■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 OSBP2Q969R2 916 aa24.89■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
NELFE-202ENST00000375429 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa24.89■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 A0A0D9SFI3 127 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 GLTPD2A6NH11 291 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 LDHCP07864 332 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 CRKP46108 304 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 OGFOD1Q8N543 542 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 HHIPL2Q6UWX4 724 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 SLF2Q8IX21 1173 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 TEKT1Q969V4 418 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa24.87■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 GAKO14976 1311 aa24.87■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 MICALL2Q8IY33 904 aa24.87■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.87■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 GPRC5DQ9NZD1 345 aa24.87■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 SERPINA10Q9UK55 444 aa24.87■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa24.87■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.86■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 IL25Q9H293 177 aa24.86■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.85■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 M0R2C6 588 aa24.85■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 CFAP100Q494V2 611 aa24.85■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.85■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 ZDHHC15Q96MV8 337 aa24.85■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 MMP14P50281 582 aa24.84■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 EPS15P42566 896 aa24.84■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 CASC1Q6TDU7 716 aa24.84■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.84■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.84■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 MYOZ2Q9NPC6 264 aa24.84■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.83■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 H7C1D1 291 aa24.83■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 BTDP43251 543 aa24.83■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 PPP4CP60510 307 aa24.83■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 C8orf34Q49A92 452 aa24.83■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.83■■□□□ 1.57
NELFE-202ENST00000375429 EGFRP00533 1210 aa24.82■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 DLGAP5Q15398 846 aa24.82■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 SAMD7Q7Z3H4 446 aa24.82■■□□□ 1.56
NELFE-202ENST00000375429 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms