RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366607.4

TOMM20-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM20, Length 3,387 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20-201ENST00000366607 PDE11AQ9HCR9 933 aa13.18□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 VWA3AA6NCI4 1184 aa13.18□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 IP6K1Q92551 441 aa13.18□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 DENND2AQ9ULE3 1009 aa13.18□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 UBE2Q2LH0YL09 131 aa13.18□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 MYSM1Q5VVJ2 828 aa13.18□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 USPL1Q5W0Q7 1092 aa13.17□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa13.17□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 RASSF4Q9H2L5 321 aa13.17□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 RABEP2Q9H5N1 569 aa13.17□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 USP31Q70CQ4 1352 aa13.17□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa13.17□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 EFCAB8A8MWE9 144 aa13.17□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 KLHL10Q6JEL2 608 aa13.17□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa13.17□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 PHKBQ93100 1093 aa13.17□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 CCDC102AQ96A19 550 aa13.17□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 RTEL1Q9NZ71 1219 aa13.17□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 NRKQ7Z2Y5 1582 aa13.17□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 ATP5JP18859 108 aa13.17□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 LONRF2Q1L5Z9 754 aa13.17□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 OLFM4Q6UX06 510 aa13.17□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 A0A087WZG4 1122 aa13.16□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 TATP17735 454 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 CDC27P30260 824 aa13.16□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 CABP4P57796 275 aa13.16□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 PDE4BQ07343 736 aa13.16□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 TSGA10IPQ3SY00 556 aa13.16□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 LONRF3Q496Y0 759 aa13.16□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 ANO1Q5XXA6 986 aa13.16□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 LMBR1LQ6UX01 489 aa13.16□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 MYL5Q02045 173 aa13.16□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 GCKRQ14397 625 aa13.16□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 KLHL34Q8N239 644 aa13.16□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 HSD3B7Q9H2F3 369 aa13.16□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 ZSCAN12O43309 604 aa13.15□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 STX17P56962 302 aa13.15□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 KCNG4Q8TDN1 519 aa13.15□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 AK7Q96M32 723 aa13.15□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 MYL10Q9BUA6 226 aa13.15□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 HDAC5Q9UQL6 1122 aa13.15□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa13.15□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 NEURL1BA8MQ27 555 aa13.15□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 RNMTO43148 476 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 CCDC158Q5M9N0 1113 aa13.15□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 CNNM3Q8NE01 707 aa13.15□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 PAG1Q9NWQ8 432 aa13.15□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa13.15□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 FUT8Q9BYC5 575 aa13.15□□□□□ -0.3
TOMM20-201ENST00000366607 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa13.15□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 SOWAHDA6NJG2 315 aa13.14□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 PRC1O43663 620 aa13.14□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 KCNH5Q8NCM2 988 aa13.14□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 KBTBD3Q8NAB2 608 aa13.14□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa13.14□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 FAN1Q9Y2M0 1017 aa13.14□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 APPP05067 770 aa13.14□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 GPTP24298 496 aa13.14□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 MICU3Q86XE3 530 aa13.14□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 VSTM4Q8IW00 320 aa13.14□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 C3P01024 1663 aa13.13□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 M0R2C6 588 aa13.13□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 ADAMTS2O95450 1211 aa13.13□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa13.13□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 LEKR1Q6ZMV7 388 aa13.13□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 INTS13Q9NVM9 706 aa13.13□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa13.13□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 CCP110O43303 1012 aa13.13□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 SHC4Q6S5L8 630 aa13.13□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 PI16Q6UXB8 463 aa13.13□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 INCENPQ9NQS7 918 aa13.13□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 NEDD4P46934 1319 aa13.13□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 CASP1P29466 404 aa13.12□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 ZNF569Q5MCW4 686 aa13.12□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa13.12□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 GOLGA1Q92805 767 aa13.12□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 HAUS7Q99871 368 aa13.12□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 A0A1W2PQ27 194 aa13.12□□□□□ -0.31
TOMM20-201ENST00000366607 A0A1W2PQ64 194 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms