RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 CNIH1O95406 144 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 CRYZL1O95825 349 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 TSPAN15O95858 294 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 IGLV2-23P01705 113 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 HLA-DRB1P01911 266 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 VDAC1P21796 283 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 TNFSF8P32971 234 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 RCVRNP35243 200 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 HRH1P35367 487 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 LGALS7P47929 136 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 TAS2R46P59540 309 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 HERV-K104P61576 105 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 GNB1P62873 340 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 CX3CL1P78423 397 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 PJVKQ0ZLH3 352 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 C2orf68Q2NKX9 166 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM177Q53S58 311 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 PRR31Q5SQ13 230 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 LCNL1Q6ZST4 164 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 KCTD9Q7L273 389 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM17Q86X19 198 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 NDUFA11Q86Y39 141 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 OR4X2Q8NGF9 303 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 ABHD5Q8WTS1 349 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 C15orf40Q8WUR7 153 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 DDB2Q92466 427 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 R3HDM4Q96D70 268 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 HARBI1Q96MB7 349 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 GON7Q9BXV9 100 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 ANAPC10Q9UM13 185 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 A3GALT2U3KPV4 340 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 FABP12A6NFH5 140 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 GABARAPH6UMI1 98 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP6V0E1O15342 81 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 CA2P00918 260 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 OPN1MWP04001 364 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 CD3DP04234 171 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 IFNA6P05013 189 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 IGF1P05019 195 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 CRYGBP07316 175 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 OPN1MW2P0DN77 364 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 OPN1MW3P0DN78 364 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 GNRHRP30968 328 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 BRWD1-AS2P59051 145 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 DGCR2P98153 550 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 FXYD3Q14802 87 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 TEX38Q6PEX7 206 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF562Q6V9R5 426 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF66Q6ZN08 573 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 C18orf65Q6ZTR6 163 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP1R27Q86WC6 154 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBTB34Q8NCN2 500 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 MTFP1Q9UDX5 166 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXO7Q9Y3I1 522 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-211ENST00000588374 PLXNB1O43157 2135 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAV41A0A0B4J266 112 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 DPPA5A6NC42 116 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 NUDT19A8MXV4 375 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 TPPPO94811 219 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB3DO95716 219 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 PF4V1P10720 104 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 UBE2KP61086 200 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 TNXAQ16473 311 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 ECSCRQ19T08 205 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 VMA21Q3ZAQ7 101 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 PYHIN1Q6K0P9 492 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM65Q6PI78 240 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 IDO2Q6ZQW0 420 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 SSX9Q7RTT3 188 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 SPAG16Q8N0X2 631 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 COMMD1Q8N668 190 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 TEX45Q8NA69 505 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM229BQ8NBD8 167 aa5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.3 ms