RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 MFNGO00587 321 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 PJVKQ0ZLH3 352 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 TMEM177Q53S58 311 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 SGPP2Q8IWX5 399 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 NDUFB11Q9NX14 153 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 TRIM64CA6NLI5 447 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 RAB27BO00194 218 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 ACTL6BO94805 426 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 IGLV2-23P01705 113 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 SSX1Q16384 188 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 TNXAQ16473 311 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 TEX45Q8NA69 505 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 USMG5Q96IX5 58 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 CRYGBP07316 175 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 GALP22466 123 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 ACOT12Q8WYK0 555 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 MSGN1A6NI15 193 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 H0Y980 276 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 CRYZL1O95825 349 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 IGLV1-51P01701 117 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 C22orf42Q6IC83 251 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 HAPLN4Q86UW8 402 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 OR9G4Q8NGQ1 327 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 MUC7Q8TAX7 377 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 DNAH9Q9NYC9 4486 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-212ENST00000484841 A0A0B4J203 849 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 J3QRK9 145 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 BRI3O95415 125 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 CTXN2P0C2S0 81 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 APELAP0DMC3 54 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 UBE2KP61086 200 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 RPEL1Q2QD12 228 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 Q6ZS49 121 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 PALMDQ9NP74 551 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 RAB26Q9ULW5 256 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 SHISA3A0PJX4 238 aa15.44■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 OR9G9P0C7N8 305 aa15.44■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 CD36P16671 472 aa15.44■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 DTYMKP23919 212 aa15.44■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 DUTP33316 252 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 SYNJ2BPP57105 145 aa15.44■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 GABARAPL2P60520 117 aa15.44■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 PRSS8Q16651 343 aa15.44■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 CDNFQ49AH0 187 aa15.44■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 SNAPC3Q92966 411 aa15.44■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 FCGR3BO75015 233 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 SCGNO76038 276 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 SLC22A5O76082 557 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 ZNF343Q6P1L6 599 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 IDO2Q6ZQW0 420 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 ZNF645Q8N7E2 425 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 C5orf30Q96GV9 206 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 PEMTQ9UBM1 199 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 SMIM30A4D0T7 59 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 NOTOA8MTQ0 251 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 TUSC2O75896 110 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 PSMB9P28065 219 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 GNG2P59768 71 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 DEFA5Q01523 94 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 KCTD9Q7L273 389 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 GTSCR1Q86UQ5 136 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 MMD2Q8IY49 270 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 DDB2Q92466 427 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 SPIN2AQ99865 258 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 DCSTAMPQ9H295 470 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 LINC00473A8K010 186 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 ATP5G2Q06055 141 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 CDK10Q15131 360 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 HACD4Q5VWC8 232 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 LCN12Q6JVE5 192 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 TPRA1Q86W33 373 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 FCGR1BQ92637 280 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 SSR3Q9UNL2 185 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 OR2W1Q9Y3N9 320 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa15.4■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 FAM223BA6NKX1 122 aa15.4■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 LYL1P12980 280 aa15.4■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 DYRK1AQ13627 763 aa15.4■□□□□ 0.06
ACTB-212ENST00000484841 CNIH2Q6PI25 160 aa15.4■□□□□ 0.06
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