RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471023.1

NOP56-211, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 592 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-211ENST00000471023 LY6EQ16553 131 aa5.9□□□□□ -1.46
NOP56-211ENST00000471023 AADACL3Q5VUY0 350 aa5.9□□□□□ -1.46
NOP56-211ENST00000471023 Q6ZSV7 163 aa5.9□□□□□ -1.46
NOP56-211ENST00000471023 Q8N2B8 174 aa5.9□□□□□ -1.46
NOP56-211ENST00000471023 TMEM229BQ8NBD8 167 aa5.9□□□□□ -1.46
NOP56-211ENST00000471023 OR2AK2Q8NG84 335 aa5.9□□□□□ -1.46
NOP56-211ENST00000471023 OR10X1Q8NGY0 326 aa5.9□□□□□ -1.46
NOP56-211ENST00000471023 OR8U1Q8NH10 309 aa5.9□□□□□ -1.46
NOP56-211ENST00000471023 OR56B4Q8NH76 319 aa5.9□□□□□ -1.46
NOP56-211ENST00000471023 OR10J5Q8NHC4 309 aa5.9□□□□□ -1.46
NOP56-211ENST00000471023 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
NOP56-211ENST00000471023 TOMM40LQ969M1 308 aa5.9□□□□□ -1.46
NOP56-211ENST00000471023 RPEQ96AT9 228 aa5.9□□□□□ -1.46
NOP56-211ENST00000471023 PHF21AQ96BD5 680 aa5.9□□□□□ -1.46
NOP56-211ENST00000471023 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
NOP56-211ENST00000471023 FXYD6Q9H0Q3 95 aa5.9□□□□□ -1.46
NOP56-211ENST00000471023 AKIP1Q9NQ31 210 aa5.9□□□□□ -1.46
NOP56-211ENST00000471023 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
NOP56-211ENST00000471023 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
NOP56-211ENST00000471023 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 FABP12A6NFH5 140 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 OR5H14A6NHG9 310 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 M0QYG6 137 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 RAB29O14966 203 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 PPYP01298 95 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 IGLV2-23P01705 113 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 CD3DP04234 171 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 CSF1P09603 554 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.474e-45■■□□□ 13.5
NOP56-211ENST00000471023 GNRHRP30968 328 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 DUTP33316 252 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 CEACAM3P40198 252 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 BLCAPP62952 87 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 MSMO1Q15800 293 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 BAK1Q16611 211 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 LCE4AQ5TA78 99 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 LINC00299Q6ZSB3 139 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 TMEM219Q86XT9 240 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 Q8N9W7 124 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 MOB3AQ96BX8 217 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 GPHA2Q96T91 129 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 OR2D2Q9H210 308 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 GHITMQ9H3K2 345 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 ZNF702PQ9H963 129 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 BATF3Q9NR55 127 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 CCL28Q9NRJ3 127 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 NECAP2Q9NVZ3 263 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 PIPOXQ9P0Z9 390 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 RABL2BQ9UNT1 228 aa5.89□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 HSPA12AO43301 675 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 TXNL1O43396 289 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 OR2F2O95006 317 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 NDUFA3O95167 84 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 IGKV1D-33P01593 117 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 IGKV1-33P01594 117 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 OPN1MWP04001 364 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 IGKV1-16P04430 117 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 CRYGBP07316 175 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 OPN1MW2P0DN77 364 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 OPN1MW3P0DN78 364 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 VSIG10L2P0DP72 767 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 IL3RAP26951 378 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 CNTFRP26992 372 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 F2RL1P55085 397 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 ACTBP60709 375 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 IL18Q14116 193 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 ZNF645Q8N7E2 425 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 OR13C8Q8NGS7 320 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 OR2T6Q8NHC8 308 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 C15orf40Q8WUR7 153 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 FCAMRQ8WWV6 532 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 IFT46Q9NQC8 304 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 SERTAD4Q9NUC0 356 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 EHFQ9NZC4 300 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 PTTG2Q9NZH5 202 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 SIGLEC9Q9Y336 463 aa5.88□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 LINC01548A6NM66 108 aa5.87□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 J3QRK9 145 aa5.87□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 M0R1X1 148 aa5.87□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 RBBP9O75884 186 aa5.87□□□□□ -1.47
NOP56-211ENST00000471023 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms