RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR4A4PQ8NGN8 299 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARPC1AQ92747 370 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLA2Q9H6Q3 261 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB22AQ9UL26 194 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 M0R1X1 148 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A17O43808 307 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD3GP09693 182 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FABP7O15540 132 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLA2G7Q13093 441 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FXYD3Q14802 87 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACSM6Q6P461 480 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRPEL2Q8TAA5 225 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB3CQ96E17 227 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RHOVQ96L33 236 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC35D1Q9NTN3 355 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RYR3Q15413 4870 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BET1O15155 118 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRGV3P03979 118 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR8U9P0C7N5 309 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPNP16150 400 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PITPNAQ00169 270 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNK7Q9Y2U2 307 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDCD5O14737 125 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGSF11Q5DX21 431 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR10J5Q8NHC4 309 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2D2Q9H210 308 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNIH1O95406 144 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FCGR3AP08637 254 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GP9P14770 177 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MOGAT2Q3SYC2 334 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR4C12Q96R67 309 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CABLES2Q9BTV7 478 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSTT2P0CG29 244 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSTT2BP0CG30 244 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GADD45AP24522 165 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LGALS7P47929 136 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF367Q7RTV3 350 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POC5Q8NA72 575 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR10R2Q8NGX6 335 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VCX3BQ9H321 246 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SDHAF2Q9NX18 166 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H3BUA1 57 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV2-23P01705 113 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNB3P16520 340 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR10A3P58181 314 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CBX3Q13185 183 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSX1Q16384 188 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR5T1Q8NG75 326 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A075B6Q4 140 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERICH4A6NGS2 130 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFITM5A6NNB3 132 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DIRAS3O95661 229 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PJVKQ0ZLH3 352 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OVCH2Q7RTZ1 564 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SBSPONQ8IVN8 264 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAFIPQ8WZ33 124 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HARBI1Q96MB7 349 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELOVL1Q9BW60 279 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BLOC1S6Q9UL45 172 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MFNGO00587 321 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRYGBP07316 175 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB6AP20340 208 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYL9P24844 172 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSPA13P48723 471 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNBD2Q96M20 576 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0G2JLM5 398 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHISA3A0PJX4 238 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB27BO00194 218 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RTL8BQ17RB0 113 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM177Q53S58 311 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IZUMO2Q6UXV1 221 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BVESQ8NE79 360 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM68Q96MH6 324 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GINS4Q9BRT9 223 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDUFB11Q9NX14 153 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STUB1Q9UNE7 303 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 METTL21EPA6NDL7 271 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM64CA6NLI5 447 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C3orf84H3BNL1 204 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHOXO15266 292 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB3BP20337 219 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZP3P21754 424 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms