RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441587.2

ALMS1-IT1-201, ALMS1 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ALMS1-IT1, Length 2,107 nt, Biotype sense intronic.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CD14P08571 375 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PSG1P11464 419 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CD99P14209 185 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CD1DP15813 335 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 OR1D4P47884 311 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 FOXA1P55317 472 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 RPS24P62847 133 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 BTG2P78543 158 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 KIAA0040Q15053 153 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ZNF343Q6P1L6 599 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 STAG3L4Q8TBR4 150 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SLC37A2Q8TED4 501 aa4.85□□□□□ -1.63
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ALMS1-IT1-201ENST00000441587 DDIT4LQ96D03 193 aa4.85□□□□□ -1.63
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ALMS1-IT1-201ENST00000441587 IP6K3Q96PC2 410 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 FAM173AQ9BQD7 235 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 AGMATQ9BSE5 352 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TSSK6Q9BXA6 273 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SLC17A9Q9BYT1 436 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SMIM3Q9BZL3 60 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ATG5Q9H1Y0 275 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
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ALMS1-IT1-201ENST00000441587 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.85□□□□□ -1.63
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ALMS1-IT1-201ENST00000441587 M0R129 80 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 HPRT1P00492 218 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 AMBPP02760 352 aa4.85□□□□□ -1.63
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ALMS1-IT1-201ENST00000441587 FAM157CP0CG43 387 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CT45A6P0DMU7 189 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CT45A5P0DMU8 189 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CT45A7P0DMV0 189 aa4.85□□□□□ -1.63
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ALMS1-IT1-201ENST00000441587 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PLP2Q04941 152 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 EBPQ15125 230 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CLEC12BQ2HXU8 276 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CT45A1Q5HYN5 189 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 FBXW12Q6X9E4 464 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 OR8I2Q8N0Y5 310 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CT45A3Q8NHU0 189 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa4.85□□□□□ -1.63
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ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SLC35E1Q96K37 410 aa4.85□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 EBPLQ9BY08 206 aa4.85□□□□□ -1.63
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ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ARRDC5A6NEK1 342 aa4.84□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 C2CD4DB7Z1M9 353 aa4.84□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ZNF814B7Z6K7 855 aa4.84□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 J3KT08 172 aa4.84□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CXCL13O43927 109 aa4.84□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 OR4A8P0C604 315 aa4.84□□□□□ -1.63
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ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SSR4P51571 173 aa4.84□□□□□ -1.63
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ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa4.84□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 LCE1DQ5T752 114 aa4.84□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 C11orf87Q6NUJ2 197 aa4.84□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 OR5AP2Q8NGF4 316 aa4.84□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 OR51A2Q8NGJ7 313 aa4.84□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 MFSD8Q8NHS3 518 aa4.84□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 RASL10AQ92737 203 aa4.84□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ATOH8Q96SQ7 321 aa4.84□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.84□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PELI2Q9HAT8 420 aa4.84□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 NTNG1Q9Y2I2 539 aa4.84□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa4.84□□□□□ -1.63
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 A0A087WWC5 75 aa4.84□□□□□ -1.64
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 A0A0G2JLM5 398 aa4.84□□□□□ -1.64
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 M0R2Z0 102 aa4.84□□□□□ -1.64
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 MMP23AO75900 390 aa4.84□□□□□ -1.64
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 GAGE7O76087 117 aa4.84□□□□□ -1.64
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 GAGE12FP0CL80 117 aa4.84□□□□□ -1.64
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 GAGE12GP0CL81 117 aa4.84□□□□□ -1.64
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 GAGE12IP0CL82 117 aa4.84□□□□□ -1.64
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 NPY1RP25929 384 aa4.84□□□□□ -1.64
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CMPK1P30085 196 aa4.84□□□□□ -1.64
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 GALR1P47211 349 aa4.84□□□□□ -1.64
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 AMTP48728 403 aa4.84□□□□□ -1.64
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 RUNX1Q01196 453 aa4.84□□□□□ -1.64
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ARL16Q0P5N6 197 aa4.84□□□□□ -1.64
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 GAGE4Q13068 117 aa4.84□□□□□ -1.64
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