RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
NME3-211ENST00000568561 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
NME3-211ENST00000568561 LAIR2Q6ISS4 152 aa11.9□□□□□ -0.5
NME3-211ENST00000568561 PYHIN1Q6K0P9 492 aa11.9□□□□□ -0.5
NME3-211ENST00000568561 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa11.9□□□□□ -0.5
NME3-211ENST00000568561 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
NME3-211ENST00000568561 RHOVQ96L33 236 aa11.9□□□□□ -0.5
NME3-211ENST00000568561 EDA2RQ9HAV5 297 aa11.9□□□□□ -0.5
NME3-211ENST00000568561 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa11.9□□□□□ -0.5
NME3-211ENST00000568561 GHRLQ9UBU3 117 aa11.9□□□□□ -0.5
NME3-211ENST00000568561 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
NME3-211ENST00000568561 RNF150Q9ULK6 438 aa11.9□□□□□ -0.5
NME3-211ENST00000568561 STUB1Q9UNE7 303 aa11.9□□□□□ -0.5
NME3-211ENST00000568561 LRRC42Q9Y546 428 aa11.9□□□□□ -0.5
NME3-211ENST00000568561 ANKRD34BA5PLL1 514 aa11.89□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 LDLRAD4O15165 306 aa11.89□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 IGLV1-51P01701 117 aa11.89□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 IGKV1-16P04430 117 aa11.89□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 GNAO1P09471 354 aa11.89□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 UBBP0CG47 229 aa11.89□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 CPEP16870 476 aa11.89□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 AKIRIN2Q53H80 203 aa11.89□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 ZNF880Q6PDB4 577 aa11.89□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 LRRTM1Q86UE6 522 aa11.89□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa11.89□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 SETD9Q8NE22 299 aa11.89□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 OR5AN1Q8NGI8 311 aa11.89□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 AGMATQ9BSE5 352 aa11.89□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 HSPA12AO43301 675 aa11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 SLC25A17O43808 307 aa11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 PROP1O75360 226 aa11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 RBBP9O75884 186 aa11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 ARSBP15848 533 aa11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 MC5RP33032 325 aa11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 ACSM3Q53FZ2 586 aa11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 TTC23Q5W5X9 447 aa11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 ZNF562Q6V9R5 426 aa11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 MOB1BQ7L9L4 216 aa11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 SGPP2Q8IWX5 399 aa11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 ZNF383Q8NA42 475 aa11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 OR5T1Q8NG75 326 aa11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 ISOC1Q96CN7 298 aa11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 TMED9Q9BVK6 235 aa11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 ELOVL1Q9BW60 279 aa11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 SLA2Q9H6Q3 261 aa11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 C19orf73Q9NVV2 129 aa11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 AK3Q9UIJ7 227 aa11.88□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 SOCS1O15524 211 aa11.87□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 TFAP2AP05549 437 aa11.87□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 CD1AP06126 327 aa11.87□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 CEACAM6P40199 344 aa11.87□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 RPS16P62249 146 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 HLA-DRB3P79483 266 aa11.87□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 QRFPP83859 136 aa11.87□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 FXYD3Q14802 87 aa11.87□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 C1orf100Q5SVJ3 147 aa11.87□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 GLT8D1Q68CQ7 371 aa11.87□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 DHRSXQ8N5I4 330 aa11.87□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 POC5Q8NA72 575 aa11.87□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 KCNG3Q8TAE7 436 aa11.87□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 TM2D1Q9BX74 207 aa11.87□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa11.87□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa11.87□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 ADAM30Q9UKF2 790 aa11.87□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 TMEM14DPA8MWL7 114 aa11.86□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 SLC22A1O15245 554 aa11.86□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 SCTP09683 121 aa11.86□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 CD40LGP29965 261 aa11.86□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 PJVKQ0ZLH3 352 aa11.86□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 P2RY14Q15391 338 aa11.86□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 NANOGP1Q8N7R0 232 aa11.86□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa11.86□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 THRSPQ92748 146 aa11.86□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 LPAR5Q9H1C0 372 aa11.86□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa11.85□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa11.85□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 ZBTB25P24278 435 aa11.85□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 SYNJ2BPP57105 145 aa11.85□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 EDARADDQ8WWZ3 215 aa11.85□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 RNF5Q99942 180 aa11.85□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa11.84□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 M0R1X1 148 aa11.84□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 ITGB1BP1O14713 200 aa11.84□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 SPDEFO95238 335 aa11.84□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 CNIH1O95406 144 aa11.84□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 BPNT1O95861 308 aa11.84□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 TRBV12-3P01733 135 aa11.84□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 APOA2P02652 100 aa11.84□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 APELAP0DMC3 54 aa11.84□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 ZP3P21754 424 aa11.84□□□□□ -0.51
NME3-211ENST00000568561 HAGHQ16775 308 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.3 ms