RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDNFQ49AH0 187 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 IYDQ6PHW0 289 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 PATE2Q6UY27 113 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 TEX9Q8N6V9 391 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 NKAIN3Q8N8D7 197 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIFAP3Q92845 792 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 FMC1Q96HJ9 113 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 TBC1D24Q9ULP9 559 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 HHLA2Q9UM44 414 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A0J9YW62 118 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1B0GXF2 115 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 SYCE3A1L190 88 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 GOLGA8JA6NMD2 632 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYB5BO43169 146 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZMPSTE24O75844 475 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 GOLGA8HP0CJ92 632 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC1A1P43005 524 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 CRYBB2P43320 205 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 BPIFB3P59826 476 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 GTF2BQ00403 316 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF826PQ6ZT77 177 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR8H2Q8N162 312 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 C10orf53Q8N6V4 93 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 C22orf15Q8WYQ4 148 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 AGMATQ9BSE5 352 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 CALN1Q9BXU9 219 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 USP47Q96K76 1375 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 FUOMA2VDF0 154 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCNB2O95067 398 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 NDUFB2O95178 105 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 RLN2P04090 185 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL10P22301 178 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALDH3A1P30838 453 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 TOMM20Q15388 145 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC50A1Q9BRV3 221 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSTPIP2Q9H939 334 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF11Q9Y3C5 154 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 FIS1Q9Y3D6 152 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTPRFP10586 1907 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 C21orf140B9A014 251 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCGB2A1O75556 95 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSMG1O95456 288 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 FXYD4P59646 89 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKDD1AQ495B1 522 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 NDUFAF7Q7L592 441 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 RMND5AQ9H871 391 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 BEX1Q9HBH7 125 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 SIP14410 1827 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAST2Q6P0Q8 1798 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTC21AQ8NDW8 1320 aa-3.41□□□□□ -2.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 K7EQZ3 153 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 LYZL6O75951 148 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 BNIP2Q12982 314 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 TFDP2Q14188 446 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 C6orf226Q5I0X4 101 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 AMTNQ6UX39 209 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 CRLF3Q8IUI8 442 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q8IZM0 81 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 LYPD6BQ8NI32 183 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 RILPQ96NA2 401 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR7D2Q96RA2 312 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 NMRK1Q9NWW6 199 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIK3R4Q99570 1358 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIF16BQ96L93 1317 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A0D9SG52 128 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 H3BP45 60 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 H7C0C1 242 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYO1DO94832 1006 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR5F1O95221 314 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD160O95971 181 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD14P08571 375 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 METTL15P1P0C7V9 234 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP5OP48047 213 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 STC1P52823 247 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 NDUFA5Q16718 116 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 C9orf64Q5T6V5 341 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 SFT2D1Q8WV19 159 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP-3.42□□□□□ -2.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.7 ms