RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 CLCC1Q96S66 551 aa15.65■□□□□ 0.1
ACTB-212ENST00000484841 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
ACTB-212ENST00000484841 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
ACTB-212ENST00000484841 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
ACTB-212ENST00000484841 ISYNA1Q9NPH2 558 aa15.65■□□□□ 0.1
ACTB-212ENST00000484841 OR1A1Q9P1Q5 309 aa15.65■□□□□ 0.1
ACTB-212ENST00000484841 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
ACTB-212ENST00000484841 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa15.65■□□□□ 0.1
ACTB-212ENST00000484841 ERICH4A6NGS2 130 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 SAP30O75446 220 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 APOA2P02652 100 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 CD37P11049 281 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 RPS16P62249 146 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 RPS25P62851 125 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 TPBGQ13641 420 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 IRF3Q14653 427 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 FAM89BQ8N5H3 189 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 OR56B1Q8NGI3 324 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 OR5AN1Q8NGI8 311 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 Q9N2K0 584 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 SCTP09683 121 aa15.63■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 CALRP27797 417 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
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ACTB-212ENST00000484841 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa15.63■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 ASCL2Q99929 193 aa15.63■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
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ACTB-212ENST00000484841 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa15.63■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD65E5RJM6 399 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 FCN1O00602 326 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 DENRO43583 198 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
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ACTB-212ENST00000484841 TFAP2AP05549 437 aa15.62■□□□□ 0.09
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ACTB-212ENST00000484841 SERPINB10P48595 397 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 SLURP1P55000 103 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 AQP4P55087 323 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 TPPP2P59282 170 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 NDPQ00604 133 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 PSG5Q15238 335 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 AKIRIN2Q53H80 203 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 ASPHD1Q5U4P2 390 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 ZNF562Q6V9R5 426 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 PDPNQ86YL7 162 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 CASTOR1Q8WTX7 329 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 PTX4Q96A99 478 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 FAM3DQ96BQ1 224 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 MS4A10Q96PG2 267 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 AGMATQ9BSE5 352 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
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ACTB-212ENST00000484841 TOLLIPQ9H0E2 274 aa15.62■□□□□ 0.09
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ACTB-212ENST00000484841 ACOT13Q9NPJ3 140 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 V9GY05 133 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 TRDCB7Z8K6 153 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 CA2P00918 260 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 CLDN12P56749 244 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 PITPNAQ00169 270 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 CBX3Q13185 183 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 C2orf76Q3KRA6 126 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 TMEM91Q6ZNR0 172 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 LFNGQ8NES3 379 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 OR4C12Q96R67 309 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 VCX3BQ9H321 246 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 DUSP21Q9H596 190 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 RDH8Q9NYR8 311 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 PDCD5O14737 125 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
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ACTB-212ENST00000484841 CNIH1O95406 144 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 IGHV3-11P01762 117 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 C19orf54Q5BKX5 351 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 ARPC1AQ92747 370 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 GFI1Q99684 422 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 MGLLQ99685 303 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 SLC35D1Q9NTN3 355 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 RAB22AQ9UL26 194 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 A0A087WW49 117 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 M0R1X1 148 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 TRGV3P03979 118 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 OR8U9P0C7N5 309 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 GADD45AP24522 165 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 TMEM50BP56557 158 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 FABP5Q01469 135 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 FXYD3Q14802 87 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 HES5Q5TA89 166 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTB-212ENST00000484841 PRSS48Q7RTY5 328 aa15.59■□□□□ 0.09
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