RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HSFY1Q96LI6 401 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MS4A4EQ96PG1 132 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NPY6RQ99463 290 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FEZ1Q99689 392 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SPATA9Q9BWV2 254 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRRG4Q9BZD6 226 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR51I2Q9H344 312 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DPAGT1Q9H3H5 408 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMEM9BQ9NQ34 198 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KCNIP2Q9NS61 270 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BFARQ9NZS9 450 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PNMA2Q9UL42 364 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CLIC4Q9Y696 253 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GGT3PA6NGU5 568 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR5H14A6NHG9 310 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ANKDD1BA6NHY2 528 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 J3KTA2 159 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RDH16O75452 317 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GADD45GO95257 159 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GALTP07902 379 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TFPTP0C1Z6 253 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 STAG3L1P0CL83 205 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SRGAP2BP0DMP2 458 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TXNP10599 105 aaKnown RBP-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EPCAMP16422 314 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RAB3AP20336 220 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RAB3BP20337 219 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MPZP25189 248 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KLRK1P26718 216 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LAP3P28838 519 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 S100A5P33763 92 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TALDO1P37837 337 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MVDP53602 400 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CLDN12P56749 244 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ELP6Q0PNE2 266 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RCN1Q15293 331 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ITPRIPQ8IWB1 547 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCNYL1Q8N7R7 359 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CAMKVQ8NCB2 501 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NUP35Q8NFH5 326 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SPSB1Q96BD6 273 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RASD2Q96D21 266 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SGSM3Q96HU1 749 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ISCA1Q9BUE6 129 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SAMD10Q9BYL1 202 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC25A31Q9H0C2 315 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 UQCC1Q9NVA1 299 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TAS2R10Q9NYW0 307 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CALYQ9NYX4 217 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LGALS13Q9UHV8 139 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC22A13Q9Y226 551 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PIGLQ9Y2B2 252 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMED5Q9Y3A6 229 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LY96Q9Y6Y9 160 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LRP5O75197 1615 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 UBR1Q8IWV7 1749 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SHTN1A0MZ66 631 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC5A10A0PJK1 596 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMEM72A0PK05 275 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LRRC72A6NJI9 287 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LRRN3E7EW58 273 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PLPP1O14494 284 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EI24O14681 340 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CLDN3O15551 220 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MED7O43513 233 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SSX4O60224 188 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COX7A2P2O60397 106 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CTNSO60931 367 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCNB2O95067 398 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGHV3-7P01780 117 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COX6A1P12074 109 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COX4I1P13073 169 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MIFP14174 115 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IDO1P14902 403 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CRHBPP24387 322 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AKAP5P24588 427 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ADD2P35612 726 aa-3.27□□□□□ -2.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms