RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 COX5BP10606 129 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 GZMHP20718 246 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 CEACAM6P40199 344 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 ERVS71-1P61550 626 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 SERF2P84101 59 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 NCR3LG1Q68D85 454 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 FGFRL1Q8N441 504 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 P2RX4Q99571 388 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 PLA2G3Q9NZ20 509 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 LOC400499M0QZD8 3231 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 IL2RGP31785 369 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 COL10A1Q03692 680 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 PLP2Q04941 152 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 MEGF10Q96KG7 1140 aa14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 OR5B21A6NL26 309 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 SYNGR4O95473 234 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF497Q6ZNH5 498 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 MPC1Q9Y5U8 109 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 KRASP01116 189 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 DCAF12Q5T6F0 453 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 CLN8Q9UBY8 286 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 NAT8Q9UHE5 227 aa14.6□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 MED13Q9UHV7 2174 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 IGHEP01854 428 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 APLNRP35414 380 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 G6PCP35575 357 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 ARR3P36575 388 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 P2RY6Q15077 328 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 TTTY12Q9BZ98 90 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 DSPP15924 2871 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 A0A1B0GV90 55 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 J3QT63 122 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 PFN1P07737 140 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 RPL23P62829 140 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 TNFRSF9Q07011 255 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 C5orf30Q96GV9 206 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 FAM173AQ9BQD7 235 aa14.59□□□□□ -0.07
PDE4A-201ENST00000293683 SMCO3A2RU48 225 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 IL18BPO95998 194 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 IFNA1P01562 189 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 WNT2P09544 360 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 DDTP30046 118 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 SSPNQ14714 243 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 PRSS8Q16651 343 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 ALKBH6Q3KRA9 238 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 SPINK9Q5DT21 86 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 SCCPDHQ8NBX0 429 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 PITPNC1Q9UKF7 332 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 CDIPTO14735 213 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 AMBPP02760 352 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 TFF1P04155 84 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 CELA3BP08861 270 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 RPL30P62888 115 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM241Q24JQ0 296 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 BSXQ3C1V8 233 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 LINC00696Q6ZRV3 163 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 MDP1Q86V88 176 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 GPR87Q9BY21 358 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 PKIBQ9C010 78 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 PARLQ9H300 379 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 LOXL2Q9Y4K0 774 aa14.58□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 LINC00205P59089 165 aa14.57□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 PMP22Q01453 160 aa14.57□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 TFF3Q07654 80 aa14.57□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 WDYHV1Q96HA8 205 aa14.57□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 CTDSP1Q9GZU7 261 aa14.57□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 KBTBD11O94819 623 aa14.57□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 RNF224P0DH78 156 aa14.57□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 BMP5P22003 454 aa14.57□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM183AQ8IXX5 376 aa14.57□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM251Q8N6I4 163 aa14.57□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 OR51G1Q8NGK1 321 aa14.57□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 OR4F5Q8NH21 305 aa14.57□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 OR1L1Q8NH94 360 aa14.57□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 OR4F4Q96R69 305 aa14.57□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.57□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.57□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 KMT2EQ8IZD2 1858 aa14.57□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 A0A087X0M5 115 aa14.56□□□□□ -0.08
PDE4A-201ENST00000293683 A0A1B0GX30 115 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms