RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	RRH	O14718	337 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	APOL3	O95236	402 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	IL3RA	P26951	378 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINC00205	P59089	165 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	MICA	Q29983	383 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAHD1	Q6P587	224 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCDC140	Q96MF4	163 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	FEV	Q99581	238 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	CST11	Q9H112	138 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		6.34	□□□□□ -1.39
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ERICH4	A6NGS2	130 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARPC2	O15144	300 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	LANCL1	O43813	399 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDK2AP2	O75956	126 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	CA2	P00918	260 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM225B	P0DP42	221 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	FOLR2	P14207	255 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDK5	Q00535	292 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPEL1	Q2QD12	228 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	TM4SF20	Q53R12	229 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	LPCAT4	Q643R3	524 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	LAX1	Q8IWV1	398 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRR18	Q8N4B5	295 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	POC5	Q8NA72	575 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAB21	Q9UL25	225 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		6.33	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	C2orf70	A6NJV1	201 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPP5D1	E7EU14	171 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRKY	O43930	277 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	E2F6	O75461	281 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRT36	O76013	467 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	SERPINA3	P01011	423 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRH1	P02810	166 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ATP6V1B2	P21281	511 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651		Q6ZWC4	215 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	CROCCP2	Q86T23	111 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRT84	Q9NSB2	600 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	GNG12	Q9UBI6	72 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	MLX	Q9UH92	298 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAT1	Q14517	4588 aa		6.32	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A1W2PP11	408 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	C16orf90	A8MZG2	172 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	TXNL1	O43396	289 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR2A4	O95047	310 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	HBZ	P02008	142 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	MT-ND4	P03905	459 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	GZMH	P20718	246 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRKACG	P22612	351 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRKACB	P22694	351 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	MFAP2	P55001	183 aa		6.31	□□□□□ -1.4
NIF3L1-206	ENST00000416651	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4

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