RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362957.1

RNU6-1290P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1290, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1290P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR2T5Q6IEZ7 315 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CLEC19AQ6UXS0 136 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CASC2Q6XLA1 102 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ELMOD2Q8IZ81 293 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR2T29Q8NH02 315 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C22orf15Q8WYQ4 148 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ATP6V0BQ99437 205 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC50A1Q9BRV3 221 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM175Q9BSA9 504 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC5A7Q9GZV3 580 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC2A9Q9NRM0 540 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C14orf105Q9NVL8 296 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DNAJB9Q9UBS3 223 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NAT8Q9UHE5 227 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PIGLQ9Y2B2 252 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TTC21AQ8NDW8 1320 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 JCADQ9P266 1359 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CUX2O14529 1486 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 UNC13BO14795 1591 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 A0A087WTM6 91 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 A0A1W2PRV1 198 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 A4D1N5 150 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PRORSD1PA6NEY8 169 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GOLGA8SH3BPF8 625 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NME4O00746 187 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ACOX3O15254 700 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR5F1O95221 314 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HPRT1P00492 218 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PTHP01270 115 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ABHD2P08910 425 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCL3P10147 92 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NCK1P16333 377 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PSMB8P28062 276 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TAS2R30P59541 319 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 STX1BP61266 288 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C2orf80Q0P641 193 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TGFBIQ15582 683 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MEP1BQ16820 701 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NADK2Q4G0N4 442 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PDZK1Q5T2W1 519 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MFSD4BQ5TF39 518 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PKD1L2Q7Z442 2459 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RAB43Q86YS6 212 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TEX9Q8N6V9 391 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCNYL1Q8N7R7 359 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 BCORP1Q8N888 145 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 WFDC11Q8NEX6 87 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SPATA4Q8NEY3 305 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR4F6Q8NGB9 312 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR4K2Q8NGD2 314 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FNDC9Q8TBE3 224 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCDC110Q8TBZ0 833 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ING5Q8WYH8 240 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GTF2H4Q92759 462 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GALMQ96C23 342 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LINC01587Q99440 93 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PRR15LQ9BU68 103 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TTTY13Q9BZ97 58 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HRASLS2Q9NWW9 162 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ACTR3BQ9P1U1 418 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PRO0628Q9UI54 55 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 AP3M1Q9Y2T2 418 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-1290P-201ENST00000362957 A0A0C4DFX4 3053 aa-1.53□□□□□ -2.66
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PLCE1Q9P212 2302 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GREB1Q4ZG55 1949 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GOLGA8JA6NMD2 632 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ANKRD65E5RJM6 399 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1290P-201ENST00000362957 J3QLI3 93 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1290P-201ENST00000362957 BCKDKO14874 412 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1290P-201ENST00000362957 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCL16O15467 120 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ALOX12BO75342 701 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1290P-201ENST00000362957 VPS26AO75436 327 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LTAP01374 205 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HLA-HP01893 362 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CXCL10P02778 98 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GOLGA8HP0CJ92 632 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CT45A6P0DMU7 189 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CT45A5P0DMU8 189 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CT45A7P0DMV0 189 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GABRG2P18507 467 aa-1.54□□□□□ -2.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms