RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 UFD1Q92890 307 aa8.4□□□□□ -1.06
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NELFE-213ENST00000494956 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 CNBD2Q96M20 576 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 UQCC2Q9BRT2 126 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 ANKRD60Q9BZ19 345 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 SPACA1Q9HBV2 294 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 TPRKBQ9Y3C4 175 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-213ENST00000494956 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
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NELFE-213ENST00000494956 FAM90A7PA6NKC0 464 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 SPINT2O43291 252 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 IGLL1P15814 213 aa8.39□□□□□ -1.07
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NELFE-213ENST00000494956 C6orf183Q5T699 404 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 Q8N6K4 173 aa8.39□□□□□ -1.07
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NELFE-213ENST00000494956 PHYHIPQ92561 330 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 OR4F4Q96R69 305 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 TMEM59Q9BXS4 323 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 CST11Q9H112 138 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 OR2S2Q9NQN1 319 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 TGP01266 2768 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 PSMB11A5LHX3 300 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 SERPINE3A8MV23 424 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 TMEM14DPA8MWL7 114 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 M0QZK8 103 aa8.38□□□□□ -1.07
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NELFE-213ENST00000494956 SOCS1O15524 211 aa8.38□□□□□ -1.07
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NELFE-213ENST00000494956 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
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NELFE-213ENST00000494956 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 SETD6Q8TBK2 473 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 THRSPQ92748 146 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 RITA1Q96K30 269 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 NEDD4LQ96PU5 975 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 MGLLQ99685 303 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.38□□□□□ -1.07
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NELFE-213ENST00000494956 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.38□□□□□ -1.07
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NELFE-213ENST00000494956 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 SHISA3A0PJX4 238 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 FGF16O43320 207 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 UBBP0CG47 229 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 CD37P11049 281 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 CPEP16870 476 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 CD33P20138 364 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 IL3RAP26951 378 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 CNTFRP26992 372 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 CD1BP29016 333 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 OR3A3P47888 321 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 HMGN3Q15651 99 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 SSX1Q16384 188 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 ETV3LQ6ZN32 361 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 PRSS48Q7RTY5 328 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 STPG2Q8N412 459 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 SVOPQ8N4V2 548 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 OR51D1Q8NGF3 324 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 OR2T10Q8NGZ9 312 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 KCNG3Q8TAE7 436 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 IL1F10Q8WWZ1 152 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 PHF21AQ96BD5 680 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 DUX3Q96PT4 197 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 TM2D1Q9BX74 207 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 PLGRKTQ9HBL7 147 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 A0A0B4J203 849 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 SLC17A2O00624 439 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 ST8SIA5O15466 376 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 CA11O75493 328 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 MOSP00540 346 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 IGHG2P01859 326 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-213ENST00000494956 PF4P02776 101 aa8.36□□□□□ -1.07
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