RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452550.5

SH3BGR-208, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SH3BGR, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BGR-208	ENST00000452550	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	CORO2A	Q92828	525 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	RPE	Q96AT9	228 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	CNBD2	Q96M20	576 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF649	Q9BS31	505 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMED9	Q9BVK6	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	RAB26	Q9ULW5	256 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	LRRC42	Q9Y546	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	OOSP1	A8MZH6	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550		M0QZK8	103 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	PDCD5	O14737	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	IL1A	P01583	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGKV1D-12	P01611	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	GLA	P06280	429 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM106CP	P0CH98	169 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR3A4P	P47883	348 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	GLIPR1	P48060	266 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZP1	P60852	638 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	TAF9	Q16594	264 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	XAF1	Q6GPH4	301 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	ASCL4	Q6XD76	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	MUL1	Q969V5	352 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	DERL3	Q96Q80	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	AIP	O00170	330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	FCN3	O75636	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	TSPAN9	O75954	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	RGS11	O94810	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	LALBA	P00709	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	MGMT	P16455	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	SRM	P19623	302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	FUT3	P21217	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	MYL9	P24844	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	HTR2C	P28335	458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	KIR2DS4	P43632	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	RAB7A	P51149	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SH3BGR-208	ENST00000452550	DYNLT3	P51808	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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