RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635519.1

NRXN1-242, Transcript of neurexin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NRXN1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1-242ENST00000635519 SPINK8P0C7L1 97 aa4.9□□□□□ -1.62
NRXN1-242ENST00000635519 RPL8P62917 257 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
NRXN1-242ENST00000635519 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
NRXN1-242ENST00000635519 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
NRXN1-242ENST00000635519 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa4.9□□□□□ -1.62
NRXN1-242ENST00000635519 OOSP2Q86WS3 158 aa4.9□□□□□ -1.62
NRXN1-242ENST00000635519 CA13Q8N1Q1 262 aa4.9□□□□□ -1.62
NRXN1-242ENST00000635519 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa4.9□□□□□ -1.62
NRXN1-242ENST00000635519 ZNF676Q8N7Q3 588 aa4.9□□□□□ -1.62
NRXN1-242ENST00000635519 LFNGQ8NES3 379 aa4.9□□□□□ -1.62
NRXN1-242ENST00000635519 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
NRXN1-242ENST00000635519 CST11Q9H112 138 aa4.9□□□□□ -1.62
NRXN1-242ENST00000635519 TMEM134Q9H6X4 195 aa4.9□□□□□ -1.62
NRXN1-242ENST00000635519 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
NRXN1-242ENST00000635519 SH2D2AQ9NP31 389 aa4.9□□□□□ -1.62
NRXN1-242ENST00000635519 TAAR3PQ9P1P4 343 aa4.9□□□□□ -1.62
NRXN1-242ENST00000635519 PCTPQ9UKL6 214 aa4.9□□□□□ -1.62
NRXN1-242ENST00000635519 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 VWA8A3KMH1 1905 aa4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 MYLKQ15746 1914 aa4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 SFT2D2O95562 160 aa4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 HBZP02008 142 aa4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 PRH1P02810 166 aa4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 HPNP05981 417 aa4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 AKAIN1P0CW23 69 aa4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 ZNF728P0DKX0 622 aa4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 CTSEP14091 401 aa4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 SRP14P37108 136 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 CATR1Q13166 79 aa4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 DCAF12Q5T6F0 453 aa4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 C8orf86Q6ZUL3 223 aa4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 MDGA2Q7Z553 956 aa4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 OR5D13Q8NGL4 314 aa4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 KCNG3Q8TAE7 436 aa4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 NMES1Q9C002 83 aa4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 SGK2Q9HBY8 427 aa4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 VSIG4Q9Y279 399 aa4.9□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 C7orf71A4D174 169 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 ARRDC5A6NEK1 342 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 C2CD4BA6NLJ0 364 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 C21orf140B9A014 251 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 M0QYG6 137 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 M0R1X1 148 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 SERF1AO75920 110 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 IFNA1P01562 189 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 HLA-HP01893 362 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 MT-ATP8P03928 68 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 ADMP35318 185 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 LCN2P80188 198 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 TAF10Q12962 218 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 LINC01555Q8NAE3 123 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 OR2M3Q8NG83 312 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 SSC4DQ8WTU2 575 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 C15orf40Q8WUR7 153 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 PGLYRP3Q96LB9 341 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 MS4A5Q9H3V2 200 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 CACNA1AO00555 2505 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 A0A0G2JLM5 398 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 A0A0G2JNG1 304 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 FOXH1O75593 365 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 JTBO76095 146 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 JMJD7P0C870 316 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 KIR2DS5Q14953 304 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 OR8B8Q15620 311 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 CD226Q15762 336 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 FAM90A2PQ658T7 463 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 C16orf82Q7Z2V1 217 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 TMEM251Q8N6I4 163 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 OR6T1Q8NGN1 323 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 FAM213BQ8TBF2 198 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 TM2D2Q9BX73 214 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 IRGMA1A4Y4 181 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 F2Z2F3 143 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 PLPP3O14495 311 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 IL3P08700 152 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 NPY1RP25929 384 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 S100A3P33764 101 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 HRH1P35367 487 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 BSGP35613 385 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 LIM2P55344 173 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 EFNB3Q15768 340 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 TMEM215Q68D42 235 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 TEX26Q8N6G2 289 aa4.89□□□□□ -1.63
NRXN1-242ENST00000635519 TMEM105Q8N8V8 129 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.3 ms