RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR10X1Q8NGY0 326 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RILPL2Q969X0 211 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 USMG5Q96IX5 58 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MS4A14Q96JA4 679 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CABS1Q96KC9 395 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NUDCD1Q96RS6 583 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRIM62Q9BVG3 475 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HINT2Q9BX68 163 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR2J1Q9GZK6 312 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF385DQ9H6B1 395 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ACTR8Q9H981 624 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HHLA2Q9UM44 414 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KIAA0556O60303 1618 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A0G2JMP0 313 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A0X1KG70 313 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A1W2PQD3 144 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR6C6A6NF89 314 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SAGE2PA6NJ88 616 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RGS5O15539 181 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRKAB2O43741 272 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LYZL6O75951 148 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CST7O76096 145 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SERPIND1P05546 499 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CDK1P06493 297 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PYGLP06737 847 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR5AL1P0C617 328 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SEC11BP0C7V7 166 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SMIM18P0DKX4 95 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SERPINA2P20848 420 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 VAMP1P23763 118 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IL32P24001 234 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 STIP1P31948 543 aaKnown RBP-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HARS2P49590 506 aaKnown RBP-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NDUFA8P51970 172 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RBM11P57052 281 aaKnown RBP-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CDK16Q00536 496 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MC1RQ01726 317 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MELKQ14680 651 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IFI44LQ53G44 452 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF542PQ5EBM4 170 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAXCQ5TGI0 409 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ATG16L1Q676U5 607 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR6B2Q6IFH4 312 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MDP1Q86V88 176 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CEP97Q8IW35 865 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 Q8N402 240 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TTC9CQ8N5M4 171 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LINC00337Q8N6G1 96 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR4M2Q8NGB6 313 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR51A4Q8NGJ6 313 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR13C5Q8NGS8 318 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR10A6Q8NH74 314 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR5K1Q8NHB7 308 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PIH1D2Q8WWB5 315 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ELMO1Q92556 727 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GOLGA1Q92805 767 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C9orf72Q96LT7 481 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MGLLQ99685 303 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ACBD6Q9BR61 282 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GBA3Q9H227 469 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GOLPH3Q9H4A6 298 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCDC134Q9H6E4 229 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 S100A14Q9HCY8 104 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C20orf141Q9NUB4 165 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HAUS2Q9NVX0 235 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SCN3BQ9NY72 215 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IL36BQ9NZH7 164 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TSPYL4Q9UJ04 414 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ENPP5Q9UJA9 477 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GOLGA3Q08378 1498 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRAV20A0A0B4J274 112 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MEI4A8MW99 385 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 F8VRH5 84 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ANXA9O76027 345 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TCL1BO95988 128 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RLN1P04808 185 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SERPINE1P05121 402 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CHRNGP07510 517 aa-3.22□□□□□ -2.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77 ms