RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	ADAM20	O43506	726 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	TSPAN15	O95858	294 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FOSL1	P15407	271 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	ARG2	P78540	354 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	PMP22	Q01453	160 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	MDP1	Q86V88	176 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	UBALD1	Q8TB05	177 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	PRSS44	E7EML9	344 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152		H7C2Y5	167 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	SSSCA1	O60232	199 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	COX5B	P10606	129 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF44	P15621	663 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	AKR1C3	P42330	323 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	ESPL1	Q14674	2120 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	TRDC	B7Z8K6	153 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	SLC34A2	O95436	690 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	CELA3B	P08861	270 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	P2RY1	P47900	373 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	CAMLG	P49069	296 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	IL13RA2	Q14627	380 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	KIRREL1	Q96J84	757 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	MED12L	Q86YW9	2145 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	SVIL	O95425	2214 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	CD5	P06127	495 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	CD46	P15529	392 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	PMEL	P40967	661 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	KCNJ3	P48549	501 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	MPV17L	Q2QL34	196 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	GPR157	Q5UAW9	335 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	MDS2	Q8NDY4	140 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	OR51H1	Q8NH63	302 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	LINC00587	B1AMM8	73 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	KIR2DS4	P43632	304 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	GNG3	P63215	75 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	KIR2DS1	Q14954	304 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	OR2C3	Q8N628	320 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	MLX	Q9UH92	298 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	CST7	O76096	145 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	SELE	P16581	610 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	ERVS71-1	P61550	626 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF573	Q86YE8	665 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	BOD1	Q96IK1	185 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	ZFP57	Q9NU63	452 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	DANCR	P0C864	163 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	SPP1	P10451	314 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	EPHA1	P21709	976 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	HFE	Q30201	348 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF766	Q5HY98	468 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BRF1-222	ENST00000635152	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62

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