RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554186.1

LINC00520-201, long intergenic non-protein coding RNA 520, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00520, Length 831 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00520-201ENST00000554186 ABCD4O14678 606 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 AIREO43918 545 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 NDUFS7O75251 213 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 DHRS3O75911 302 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 CDRT1O95170 752 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 FARS2O95363 451 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 CST4P01036 141 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 IGHV3-13P01766 116 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 TFF1P04155 84 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 HLA-DPB1P04440 258 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 HEXAP06865 529 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 SOD3P08294 240 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 SRMP19623 302 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 CCNOP22674 350 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 CD1BP29016 333 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 GLRXP35754 106 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 NPBWR2P48146 333 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 FABP6P51161 128 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 CLDN12P56749 244 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 MXD1Q05195 221 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 UNC119Q13432 240 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 IL13RA2Q14627 380 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 MPPED2Q15777 294 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 AANATQ16613 207 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 Q499Y3 187 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 BCL2L15Q5TBC7 163 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 TMEM244Q5VVB8 128 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 SIGIRRQ6IA17 410 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 OR10K2Q6IF99 312 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 ADAM5Q6NVV9 412 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 UTS2BQ765I0 119 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 C5orf24Q7Z6I8 188 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 ANGPTL5Q86XS5 388 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 MS4A15Q8N5U1 240 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF676Q8N7Q3 588 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 NUP37Q8NFH4 326 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 OR52B4Q8NGK2 314 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 OR1J1Q8NGS3 322 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 GPR148Q8TDV2 347 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 OR5P3Q8WZ94 311 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 NRGNQ92686 78 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 SPTSSAQ969W0 71 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 TMEM106AQ96A25 262 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 SEH1LQ96EE3 360 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 TMEM68Q96MH6 324 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 MED18Q9BUE0 208 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 GON7Q9BXV9 100 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 DCSTAMPQ9H295 470 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 BATF3Q9NR55 127 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 GPR173Q9NS66 373 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 NUDT15Q9NV35 164 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 HHLA2Q9UM44 414 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 PIGLQ9Y2B2 252 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 POLR1DQ9Y2S0 133 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 CACNG2Q9Y698 323 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 ABCA2Q9BZC7 2435 aa3.55□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 USF3Q68DE3 2245 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 HELTA6NFD8 242 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 TUBAL3A6NHL2 446 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 DHRS7CA6NNS2 312 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF850A8MQ14 1090 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 F5H5P2 479 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 J3QKU1 62 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 SLC22A1O15245 554 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 XRCC2O43543 280 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 SYT7O43581 403 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 SYNGR1O43759 233 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 LANCL1O43813 399 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 GATBO75879 557 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 LY6HO94772 140 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 IGHV1-46P01743 117 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 ALDOBP05062 364 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 SFTPBP07988 381 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 OCM2P0CE71 109 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 CA6P23280 308 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 DNASE1P24855 282 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 HSD11B1P28845 292 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 APLNRP35414 380 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 CDKN1AP38936 164 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 ALDH3B1P43353 468 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 HAAOP46952 286 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 OR3A4PP47883 348 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 TMEM50BP56557 158 aa3.54□□□□□ -1.84
LINC00520-201ENST00000554186 TAS2R43P59537 309 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms