RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM206AQ9NX38 181 aa1.04□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR51B4Q9Y5P0 310 aa1.04□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 V9GYY9 64 aa1.04□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTC41PQ6P2S7 1318 aa1.04□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRB1P82279 1406 aa1.04□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COL6A6A6NMZ7 2263 aa1.03□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa1.03□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa1.03□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MUC21A0A140T8X8 626 aa1.03□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1W2PRG6 482 aa1.03□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGSF23A1L1A6 192 aa1.03□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FNDC10F2Z333 226 aa1.03□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGKV5-2P06315 115 aa1.03□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CPMP14384 443 aa1.03□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARR3P36575 388 aa1.03□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GCLMP48507 274 aa1.03□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CEACAM21Q3KPI0 293 aa1.03□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM58AQ8N1B3 248 aa1.03□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BEX2Q9BXY8 128 aa1.03□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DIABLOQ9NR28 239 aa1.03□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IFNKQ9P0W0 207 aa1.03□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BTRCQ9Y297 605 aa1.03□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTPRKQ15262 1439 aa1.03□□□□□ -2.24
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa1.03□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H0YIV9 168 aa1.02□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM250H0YL14 139 aa1.02□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NCKAP5O14513 1909 aa1.02□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAPPC3O43617 180 aa1.02□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAGEA3P43357 314 aa1.02□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DOC2AQ14183 400 aa1.02□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GUSBP1Q15486 140 aa1.02□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLEC20AQ6ZU45 233 aa1.02□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SSX7Q7RTT5 188 aa1.02□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF563Q8TA94 476 aa1.02□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DOK4Q8TEW6 326 aa1.02□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM131CQ96AQ9 280 aa1.02□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HEY1Q9Y5J3 304 aa1.02□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SDK1Q7Z5N4 2213 aa1.01□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa1.01□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A0G2JQZ4 141 aa1.01□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDCD6O75340 191 aa1.01□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGKV1D-12P01611 117 aa1.01□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANGP03950 147 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM229BQ4G0N7 80 aa1.01□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC25A45Q8N413 288 aa1.01□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CASTOR1Q8WTX7 329 aa1.01□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CACNG8Q8WXS5 425 aa1.01□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR52B2Q96RD2 323 aa1.01□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa1.01□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SDHAF2Q9NX18 166 aa1.01□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VAPAQ9P0L0 249 aa1.01□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSME2Q9UL46 239 aa1.01□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POMPQ9Y244 141 aa1.01□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTCH2Q9Y6C9 303 aa1.01□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PXDNLA1KZ92 1463 aa1□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RGS12O14924 1447 aa1□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARGFXA6NJG6 315 aa1□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SIGLEC16A6NMB1 481 aa1□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A8MWP6 167 aa1□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC2A1P11166 492 aa1□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF3P17036 446 aa1□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAB25P57735 213 aa1□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HTR4Q13639 388 aa1□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TPRXLQ17RH7 258 aa1□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SDIM1Q6ZPB5 146 aa1□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NELFBQ8WX92 580 aa1□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMBIM1Q969X1 311 aa1□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SUCNR1Q9BXA5 334 aa1□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa1□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa0.99□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1W2PPV4 95 aa0.99□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPOPO43791 374 aa0.99□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTPAP49638 278 aa0.99□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAB38P57729 211 aa0.99□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RESP18Q5W5W9 173 aa0.99□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GATD1Q8NB37 220 aa0.99□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR6N2Q8NGY6 317 aa0.99□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKHQ9HCJ1 492 aa0.99□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 F8VP50 259 aa0.98□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KDELR3O43731 214 aa0.98□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LTAP01374 205 aa0.98□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRKACAP17612 351 aa0.98□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RHOAP61586 193 aa0.98□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACTL10Q5JWF8 245 aa0.98□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa0.98□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa0.98□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR4A15Q8NGL6 344 aa0.98□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPPL2BQ8TCT7 592 aa0.98□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLDN23Q96B33 292 aa0.98□□□□□ -2.25
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATAD5Q96QE3 1844 aa0.98□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms