RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 SUMF2Q8NBJ7 301 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF555Q8NEP9 628 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 OR5AU1Q8NGC0 362 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 OR9G1Q8NH87 305 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 R3HDM4Q96D70 268 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 GPER1Q99527 375 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM138Q9NPI0 162 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 PSG11Q9UQ72 335 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF281Q9Y2X9 895 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 A0A1W2PP11 408 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 C15orf65H3BRN8 121 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 TOR1AO14656 332 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 MAGEB3O15480 346 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 HTR3BO95264 441 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 IGHV3-7P01780 117 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 CD2P06729 351 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 LPLP06858 475 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 FSTP19883 344 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 PRRX1P54821 245 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 LRRC36Q1X8D7 754 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 LYPD6Q86Y78 171 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 OSR2Q8N2R0 312 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 PACRGLQ8N7B6 248 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 ZFP41Q8N8Y5 198 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF565Q8N9K5 539 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 OR4F17Q8NGA8 305 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 RFESDQ8TAC1 157 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 MRGPRDQ8TDS7 321 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 FBLIM1Q8WUP2 373 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 GGHQ92820 318 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 GHSRQ92847 366 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 CREB3L1Q96BA8 519 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 CYYR1Q96J86 154 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 AKR1E2Q96JD6 320 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 OR4F4Q96R69 305 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 FAM192AQ9GZU8 254 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 ST3GAL6Q9Y274 331 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 XPNPEP2O43895 674 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 GNAO1P09471 354 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 BDKRB2P30411 391 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 RIPK1Q13546 671 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 TTC23Q5W5X9 447 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 WFDC9Q8NEX5 89 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 OR10A7Q8NGE5 316 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 OR56B4Q8NH76 319 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 CYGBQ8WWM9 190 aa9.5□□□□□ -0.89
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PTPRF-211ENST00000467464 TOMM40LQ969M1 308 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM80Q96HE8 168 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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PTPRF-211ENST00000467464 METTL9Q9H1A3 318 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 ING4Q9UNL4 249 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 MOB4Q9Y3A3 225 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 A0A1W2PRX2 142 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 IRGMA1A4Y4 181 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 PIN1P1O15428 100 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 MYL12AP19105 171 aa9.49□□□□□ -0.89
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PTPRF-211ENST00000467464 GNG10P50151 68 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 ARHGDIBP52566 201 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 PPP3R1P63098 170 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 LTC4SQ16873 150 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 MPV17LQ2QL34 196 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 Q499Y3 187 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 YIF1BQ5BJH7 314 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF497Q6ZNH5 498 aa9.49□□□□□ -0.89
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PTPRF-211ENST00000467464 DRAM1Q8N682 238 aa9.49□□□□□ -0.89
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PTPRF-211ENST00000467464 CAPSLQ8WWF8 208 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 MYDGFQ969H8 173 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 RPEQ96AT9 228 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 PHF21AQ96BD5 680 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 OR14A2Q96R54 314 aa9.49□□□□□ -0.89
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PTPRF-211ENST00000467464 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 A0A1W2PPE3 182 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 M0QZK8 103 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 PEX14O75381 377 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-211ENST00000467464 MT-ND4P03905 459 aa9.48□□□□□ -0.89
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