RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 PTGFRP43088 359 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 GLIPR1P48060 266 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 ARHGDIBP52566 201 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 PPP3R1P63098 170 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 SSX1Q16384 188 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 YIF1BQ5BJH7 314 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 NHLRC3Q5JS37 347 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 KRBOX4Q5JUW0 171 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 OR4D6Q8NGJ1 314 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 IFT22Q9H7X7 185 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 LINC00574Q9H8X3 128 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 DPM3Q9P2X0 92 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 H3BMQ9 156 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 GABRPO00591 440 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 CHST1O43916 411 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 IGLV1-47P01700 117 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 CELP19835 753 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 GADD45AP24522 165 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 CDK2P24941 298 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 SOX2P48431 317 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 SCN1BQ07699 218 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 DOC2BQ14184 412 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 RSU1Q15404 277 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 TRAM1Q15629 374 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 C16orf82Q7Z2V1 217 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 OR51A2Q8NGJ7 313 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 OR4P4Q8NGL7 312 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 NDNFQ8TB73 568 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 CFHR4Q92496 578 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 STUB1Q9UNE7 303 aa16.38■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa16.37■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 SLC22A1O15245 554 aa16.37■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 LALBAP00709 142 aa16.37■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 CD1AP06126 327 aa16.37■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 CGB3P0DN86 165 aa16.37■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 CGB7P0DN87 165 aa16.37■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 CEACAM3P40198 252 aa16.37■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 CNPY1Q3B7I2 92 aa16.37■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 LINC00596Q86U02 117 aa16.37■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 CDH26Q8IXH8 852 aa16.37■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 GHSRQ92847 366 aa16.37■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 COQ2Q96H96 371 aa16.37■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 TAS2R4Q9NYW5 299 aa16.37■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 SSR3Q9UNL2 185 aa16.37■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 MEGF11A6BM72 1044 aa16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 LEUTXA8MZ59 168 aa16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 OOSP1A8MZH6 123 aa16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 MMP23AO75900 390 aa16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 GALP22466 123 aa16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 PAX6P26367 422 aa16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 BDKRB2P30411 391 aa16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 BRS3P32247 399 aa16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 PRRX1P54821 245 aa16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 CTF1Q16619 201 aa16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 Q499Y3 187 aa16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 OR10A7Q8NGE5 316 aa16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 THRSPQ92748 146 aa16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 AKR1E2Q96JD6 320 aa16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 PRSS22Q9GZN4 317 aa16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 METTL9Q9H1A3 318 aa16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 CKLFQ9UBR5 152 aa16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 HILPDAQ9Y5L2 63 aa16.36■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 TRAV24A0A0B4J272 114 aa16.35■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa16.35■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 F2RL2O00254 374 aa16.35■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 RAB13P51153 203 aa16.35■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 GPR176Q14439 515 aa16.35■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 MS4A15Q8N5U1 240 aa16.35■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 ZFP41Q8N8Y5 198 aa16.35■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 S100A13Q99584 98 aa16.35■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa16.34■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 CSTBP04080 98 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 FSTP19883 344 aa16.34■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 C17orf58Q2M2W7 97 aa16.34■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 DDI2Q5TDH0 399 aa16.34■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa16.34■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa16.34■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa16.34■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 OR51E2Q9H255 320 aa16.34■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 ZNF702PQ9H963 129 aa16.34■□□□□ 0.21
PITX3-201ENST00000370002 TOR1AO14656 332 aa16.33■□□□□ 0.2
PITX3-201ENST00000370002 CSF1P09603 554 aa16.33■□□□□ 0.2
PITX3-201ENST00000370002 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP16.33■□□□□ 0.2
PITX3-201ENST00000370002 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
PITX3-201ENST00000370002 HLA-DRB5Q30154 266 aa16.33■□□□□ 0.2
PITX3-201ENST00000370002 OSR2Q8N2R0 312 aa16.33■□□□□ 0.2
PITX3-201ENST00000370002 KLHDC1Q8N7A1 406 aa16.33■□□□□ 0.2
PITX3-201ENST00000370002 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms