RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 TRIP11Q15643 1979 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 GAMTQ14353 236 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 HFEQ30201 348 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 RNF133Q8WVZ7 376 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 MISP3Q96FF7 219 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 PCGF1Q9BSM1 259 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 KIR3DL2P43630 455 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 ANKRD55Q3KP44 614 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 WDFY1Q8IWB7 410 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 OR4B1Q8NGF8 309 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 SERGEFQ9UGK8 458 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC22A20A6NK97 555 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 RHBDL1O75783 438 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF600Q6ZNG1 722 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 ZPLD1Q8TCW7 415 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 PGLYRP3Q96LB9 341 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 ATG101Q9BSB4 218 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 CBLN4Q9NTU7 201 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 PROCRQ9UNN8 238 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa16.34■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 DSPPQ9NZW4 1301 aa16.33■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 M0R1B8 84 aa16.33■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 CORTO00230 105 aa16.33■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 OR2A4O95047 310 aa16.33■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 STAG3L2P0CL84 134 aa16.33■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM211Q6ICI0 200 aa16.33■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF343Q6P1L6 599 aa16.33■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 LINC00469Q8N7U9 141 aa16.33■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 OR2D3Q8NGH3 330 aa16.33■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 MRGPRDQ8TDS7 321 aa16.33■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 OR2A7Q96R45 310 aa16.33■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa16.33■□□□□ 0.21
AMIGO1-202ENST00000369864 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 CD82P27701 267 aa16.33■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 SERF2P84101 59 aa16.33■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 C10orf35Q96D05 121 aa16.33■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 HSPB8Q9UJY1 196 aa16.33■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 MCM3APO60318 1980 aa16.33■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 OR6C3Q9NZP0 311 aa16.33■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 SEC16AO15027 2179 aa16.33■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF785A8K8V0 405 aa16.33■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 GNG10P50151 68 aa16.33■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 GABRA6Q16445 453 aa16.33■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 PDPNQ86YL7 162 aa16.33■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM252Q8N6L7 170 aa16.33■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 R3HDM4Q96D70 268 aa16.33■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 AQP10Q96PS8 301 aa16.33■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 RNF2Q99496 336 aa16.33■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 OR5B21A6NL26 309 aa16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 SRP14P37108 136 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 LRRC61Q9BV99 259 aa16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 IL36GQ9NZH8 169 aa16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 GPR132Q9UNW8 380 aa16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 SMPD2O60906 423 aa16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 ORM2P19652 201 aa16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 FZD5Q13467 585 aa16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 COL19A1Q14993 1142 aa16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 LNP1A1A4G5 178 aa16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 P01737 135 aa16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 LSM6P62312 80 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 SPATA45Q537H7 98 aa16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 FOXQ1Q9C009 403 aa16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 C5orf52A6NGY3 159 aa16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM116Q8NCL8 245 aa16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 OR1K1Q8NGR3 316 aa16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 COX14Q96I36 57 aa16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 OR4C12Q96R67 309 aa16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 KCNE5Q9UJ90 142 aa16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 ATP23Q9Y6H3 246 aa16.32■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 GAGE10A6NGK3 116 aa16.31■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 KIR2DS2P43631 304 aa16.31■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 UQCR10Q9UDW1 63 aa16.31■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 TUBD1Q9UJT1 453 aa16.31■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 NPIPB9F8W1W9 429 aa16.31■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 RPL7P18124 248 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 CTGFP29279 349 aa16.31■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 LIMS1P48059 325 aa16.31■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 TIMD4Q96H15 378 aa16.31■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 LMO7DNF2Z398 122 aa16.31■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 ISLRO14498 428 aa16.31■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 CXorf1O96002 111 aa16.31■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 HKR1P10072 659 aa16.31■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 ALKBH6Q3KRA9 238 aa16.31■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 OR13G1Q8NGZ3 307 aa16.31■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 SIT1Q9Y3P8 196 aa16.31■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 MELTFP08582 738 aa16.3■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 TRGC1P0CF51 173 aa16.3■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 SARAFQ96BY9 339 aa16.3■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF665Q9H7R5 613 aa16.3■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 CYB5R2Q6BCY4 276 aa16.3■□□□□ 0.2
AMIGO1-202ENST00000369864 FDX2Q6P4F2 183 aa16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms