RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa20.91■□□□□ 0.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PXT1Q8NFP0 134 aa20.91■□□□□ 0.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR51T1Q8NGJ9 327 aa20.91■□□□□ 0.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR52I1Q8NGK6 324 aa20.91■□□□□ 0.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SGCDQ92629 289 aa20.91■□□□□ 0.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OOSP1A8MZH6 123 aa20.9■□□□□ 0.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LY6LH3BQJ8 138 aa20.9■□□□□ 0.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGEB3O15480 346 aa20.9■□□□□ 0.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB3AP20336 220 aa20.9■□□□□ 0.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF565Q8N9K5 539 aa20.9■□□□□ 0.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR9G1Q8NH87 305 aa20.9■□□□□ 0.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa20.9■□□□□ 0.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPER1Q99527 375 aa20.9■□□□□ 0.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NECAP2Q9NVZ3 263 aa20.9■□□□□ 0.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF25Q9UIL4 384 aa20.9■□□□□ 0.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MEIKINA0A087WXM9 373 aa20.89■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa20.89■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIN1P1O15428 100 aa20.89■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PF4V1P10720 104 aa20.89■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLP1RP43220 463 aa20.89■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSCAN26Q16670 478 aa20.89■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL22Q53GT1 634 aa20.89■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UTF1Q5T230 341 aa20.89■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC121Q6ZUS5 278 aa20.89■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SATL1Q86VE3 508 aa20.89■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNIH3Q8TBE1 160 aa20.89■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa20.89■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIRREL1Q96J84 757 aa20.89■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC29A1Q99808 456 aa20.89■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAV24A0A0B4J272 114 aa20.88■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa20.88■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GABRPO00591 440 aa20.88■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CGB3P0DN86 165 aa20.88■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CGB7P0DN87 165 aa20.88■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD33P20138 364 aa20.88■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa20.88■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRAPQ8TCY5 172 aa20.88■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHF21AQ96BD5 680 aa20.88■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BARHL1Q9BZE3 327 aa20.88■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa20.88■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM118AQ9NWS6 357 aa20.88■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CALYQ9NYX4 217 aa20.88■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAH3Q8TD57 4116 aa20.88■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 M0QZK8 103 aa20.87■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AMY1AP04745 511 aa20.87■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AMY2AP04746 511 aa20.87■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOX2P48431 317 aa20.87■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL13RA2Q14627 380 aa20.87■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RSU1Q15404 277 aa20.87■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF529Q6P280 563 aa20.87■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WFDC9Q8NEX5 89 aa20.87■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR51A2Q8NGJ7 313 aa20.87■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR13A1Q8NGR1 328 aa20.87■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPEQ96AT9 228 aa20.87■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JAM3Q9BX67 310 aa20.87■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM192AQ9GZU8 254 aa20.87■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa20.87■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM106CPP0CH98 169 aa20.86■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIMS3P0CW19 117 aa20.86■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIMS4P0CW20 117 aa20.86■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C9orf152Q5JTZ5 239 aa20.86■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR4X2Q8NGF9 303 aa20.86■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR10K1Q8NGX5 313 aa20.86■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYDGFQ969H8 173 aa20.86■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOMM40LQ969M1 308 aa20.86■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAS2R4Q9NYW5 299 aa20.86■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa20.86■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 J3QR06 171 aa20.85■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL1AP01583 271 aa20.85■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD2P06729 351 aa20.85■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIGYQ3MUY2 71 aa20.85■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR148Q8TDV2 347 aa20.85■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APH1BQ8WW43 257 aa20.85■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LEAP2Q969E1 77 aa20.85■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00574Q9H8X3 128 aa20.85■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 S100A14Q9HCY8 104 aa20.85■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV3-7P01780 117 aa20.84■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PF4P02776 101 aa20.84■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLL1P15814 213 aa20.84■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNJ3P48549 501 aa20.84■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LOXL3P58215 753 aa20.84■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASCL4Q6XD76 172 aa20.84■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PQLC1Q8N2U9 271 aa20.84■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q8NFD4 153 aa20.84■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa20.84■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MOB4Q9Y3A3 225 aa20.84■□□□□ 0.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.8 ms