RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PSPC1-204ENST00000492741 PSMD1Q99460 953 aa26.68■■□□□ 1.86
PSPC1-204ENST00000492741 AKAP11Q9UKA4 1901 aa26.66■■□□□ 1.86
PSPC1-204ENST00000492741 IDH1O75874 414 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
PSPC1-204ENST00000492741 IL1R1P14778 569 aa26.66■■□□□ 1.86
PSPC1-204ENST00000492741 AOC3Q16853 763 aa26.66■■□□□ 1.86
PSPC1-204ENST00000492741 ABCF2Q9UG63 623 aa26.66■■□□□ 1.86
PSPC1-204ENST00000492741 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
PSPC1-204ENST00000492741 PPIP5K2O43314 1243 aa26.65■■□□□ 1.86
PSPC1-204ENST00000492741 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
PSPC1-204ENST00000492741 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PSPC1-204ENST00000492741 LRP2BPQ9P2M1 347 aa26.65■■□□□ 1.86
PSPC1-204ENST00000492741 JAG2Q9Y219 1238 aa26.65■■□□□ 1.86
PSPC1-204ENST00000492741 SNED1Q8TER0 1413 aa26.65■■□□□ 1.86
PSPC1-204ENST00000492741 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PSPC1-204ENST00000492741 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.64■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 RUFY2Q8WXA3 655 aa26.64■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.64■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa26.63■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 WDR66Q8TBY9 1149 aa26.63■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 FBXW7Q969H0 707 aa26.63■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 MAP3K12Q12852 859 aa26.62■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.62■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 ZBTB22O15209 634 aa26.62■■□□□ 1.85
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PSPC1-204ENST00000492741 PODNQ7Z5L7 613 aa26.62■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 TICAM2Q86XR7 235 aa26.62■■□□□ 1.85
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PSPC1-204ENST00000492741 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa26.61■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.61■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 RAI14Q9P0K7 980 aa26.61■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 RFX7Q2KHR2 1363 aa26.61■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 ECE2O60344 883 aa26.6■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 SEC24BO95487 1268 aa26.6■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 GTF2IP78347 998 aa26.6■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa26.6■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 VPS33BQ9H267 617 aa26.6■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.59■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 FAM227BQ96M60 508 aa26.59■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.59■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
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PSPC1-204ENST00000492741 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.58■■□□□ 1.85
PSPC1-204ENST00000492741 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
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PSPC1-204ENST00000492741 MAGEB6Q8N7X4 407 aa26.57■■□□□ 1.84
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PSPC1-204ENST00000492741 A0A0D9SFI3 127 aa26.56■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 NFKBIEO00221 500 aa26.56■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 ADD2P35612 726 aa26.56■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.56■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.56■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 SALL1Q9NSC2 1324 aa26.56■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 REC8O95072 547 aa26.56■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 LDHBP07195 334 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
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PSPC1-204ENST00000492741 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.56■■□□□ 1.84
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PSPC1-204ENST00000492741 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa26.55■■□□□ 1.84
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PSPC1-204ENST00000492741 HELLSQ9NRZ9 838 aa26.55■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF532Q9HCE3 1301 aa26.54■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 PRDX5P30044 214 aa26.54■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 RASSF7Q02833 373 aa26.54■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.54■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 JDP2Q8WYK2 163 aa26.54■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.54■■□□□ 1.84
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PSPC1-204ENST00000492741 APPBP2Q92624 585 aa26.53■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
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PSPC1-204ENST00000492741 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.53■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 RAD50Q92878 1312 aa26.53■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.53■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.53■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 IL25Q9H293 177 aa26.53■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 USP17L3A6NCW0 530 aa26.52■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 USP17L4A6NCW7 530 aa26.52■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.52■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PSPC1-204ENST00000492741 CYP7A1P22680 504 aa26.51■■□□□ 1.83
PSPC1-204ENST00000492741 MECOMQ03112 1051 aa26.51■■□□□ 1.83
PSPC1-204ENST00000492741 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.51■■□□□ 1.83
PSPC1-204ENST00000492741 OSBP2Q969R2 916 aa26.51■■□□□ 1.83
PSPC1-204ENST00000492741 CHD4Q14839 1912 aa26.5■■□□□ 1.83
PSPC1-204ENST00000492741 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa26.5■■□□□ 1.83
PSPC1-204ENST00000492741 YDJCA8MPS7 323 aa26.5■■□□□ 1.83
PSPC1-204ENST00000492741 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
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