RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 PSMD1Q99460 953 aa14.31□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 TAF5LO75529 589 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 MX1P20591 662 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 TIMM10P62072 90 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP14.3□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 JDP2Q8WYK2 163 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 MED23Q9ULK4 1368 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 COL4A1P02462 1669 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 SEMA3EO15041 775 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 IGSF3O75054 1194 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 TICAM2Q86XR7 235 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 XAGE2Q96GT9 111 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 SPEF2Q9C093 1822 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 UFL1O94874 794 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 ATP5JP18859 108 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 PDE1AP54750 535 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 SNED1Q8TER0 1413 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 CAPNS2Q96L46 248 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa14.27□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 TAF1P21675 1872 aa14.27□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 COL4A5P29400 1685 aa14.27□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.12
NISCH-211ENST00000488243 C6orf229H3BNL8 230 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 PDE4AP27815 886 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 CYP4F22Q6NT55 531 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 VPS37DQ86XT2 251 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 DBNDD2Q9BQY9 259 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 POLLQ9UGP5 575 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 TSKSQ9UJT2 592 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 A0A1B0GUL6 1792 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 LTBP1Q14766 1721 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 THSD7BQ9C0I4 1608 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 TRAF5O00463 557 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 EPS15P42566 896 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 ECE1P42892 770 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 WASHC4Q2M389 1173 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 CCDC102BQ68D86 513 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 SLC51AQ86UW1 340 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 MCOLN1Q9GZU1 580 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 COA1Q9GZY4 146 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 SCNN1DP51172 638 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 BMP2KLQ5H9B9 411 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 PODNQ7Z5L7 613 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 G3V3G9 751 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 AOC2O75106 756 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 IL1R1P14778 569 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 ADORA1P30542 326 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 RGS3P49796 1198 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 BCAMP50895 628 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 TTC22Q5TAA0 569 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 CST9Q5W186 159 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 HAUS7Q99871 368 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 SNAP23O00161 211 aa14.22□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 PHKA1P46020 1223 aa14.22□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 GYG1P46976 350 aa14.22□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 NIM1KQ8IY84 436 aa14.22□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 CD209Q9NNX6 404 aa14.22□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 TLL2Q9Y6L7 1015 aa14.22□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.22□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
NISCH-211ENST00000488243 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms