RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408919.7

SH3BP5-203, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-203ENST00000408919 DOCK2Q92608 1830 aa21.72■■□□□ 1.07
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SH3BP5-203ENST00000408919 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-203ENST00000408919 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-203ENST00000408919 JAG2Q9Y219 1238 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
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SH3BP5-203ENST00000408919 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
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SH3BP5-203ENST00000408919 FSD1Q9BTV5 496 aa21.65■■□□□ 1.06
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SH3BP5-203ENST00000408919 C8orf34Q49A92 452 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP5-203ENST00000408919 ABCF2Q9UG63 623 aa21.64■■□□□ 1.05
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SH3BP5-203ENST00000408919 CDC45O75419 566 aa21.62■■□□□ 1.05
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SH3BP5-203ENST00000408919 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.59■■□□□ 1.05
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SH3BP5-203ENST00000408919 JDP2Q8WYK2 163 aa21.58■■□□□ 1.05
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SH3BP5-203ENST00000408919 USP17L4A6NCW7 530 aa21.58■■□□□ 1.04
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SH3BP5-203ENST00000408919 LMNB1P20700 586 aa21.58■■□□□ 1.04
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SH3BP5-203ENST00000408919 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP5-203ENST00000408919 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP5-203ENST00000408919 RAI14Q9P0K7 980 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP5-203ENST00000408919 A0A0D9SFI3 127 aa21.57■■□□□ 1.04
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SH3BP5-203ENST00000408919 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.56■■□□□ 1.04
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SH3BP5-203ENST00000408919 CXCL9Q07325 125 aa21.56■■□□□ 1.04
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SH3BP5-203ENST00000408919 SEC24BO95487 1268 aa21.55■■□□□ 1.04
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