RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 TGFB2P61812 414 aa21.45■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.45■■□□□ 1.03
LTV1-201ENST00000367576 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 WASHC4Q2M389 1173 aa21.45■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 SPON1Q9HCB6 807 aa21.45■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 ABCF2Q9UG63 623 aa21.45■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.45■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 USP26Q9BXU7 913 aa21.44■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 SEMA3EO15041 775 aa21.43■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.43■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.43■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 RAD50Q92878 1312 aa21.43■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 DOK7Q18PE1 504 aa21.43■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.43■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 CD209Q9NNX6 404 aa21.43■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 PIM2Q9P1W9 311 aa21.43■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.43■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 DOCK2Q92608 1830 aa21.43■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 M0R2C6 588 aa21.42■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 PDE6AP16499 860 aa21.42■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.42■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 MAST3O60307 1309 aa21.42■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 SNED1Q8TER0 1413 aa21.42■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 MYH7P12883 1935 aa21.42■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 ADD2P35612 726 aa21.41■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 PTH1RQ03431 593 aa21.41■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.41■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.41■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 RAI14Q9P0K7 980 aa21.41■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.41■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 MAP3K12Q12852 859 aa21.41■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.41■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 CCDC93Q567U6 631 aa21.41■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.41■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 OSBP2Q969R2 916 aa21.41■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 EYA3Q99504 573 aa21.41■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.4■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 G3V3G9 751 aa21.39■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 IL1R1P14778 569 aa21.39■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.39■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.39■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 APPBP2Q92624 585 aa21.39■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 FBXW7Q969H0 707 aa21.39■■□□□ 1.02
LTV1-201ENST00000367576 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.39■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.39■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 AOC3Q16853 763 aa21.38■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 COA1Q9GZY4 146 aa21.38■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.37■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 PRDX5P30044 214 aa21.37■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 BCS1LQ9Y276 419 aa21.37■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 UBE3CQ15386 1083 aa21.36■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 CYP7A1P22680 504 aa21.36■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 GRIK5Q16478 980 aa21.36■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 VPS53Q5VIR6 699 aa21.36■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.36■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 TICAM2Q86XR7 235 aa21.36■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.36■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.36■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 PALD1Q9ULE6 856 aa21.36■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 PPIP5K2O43314 1243 aa21.35■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 GTF2IP78347 998 aa21.35■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.35■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 MCCP23508 829 aa21.34■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.34■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.34■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 ZNF384Q8TF68 577 aa21.34■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 MAST2Q6P0Q8 1798 aa21.34■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 GPAA1O43292 621 aa21.34■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 ECE2O60344 883 aa21.34■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 MECOMQ03112 1051 aa21.34■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.33■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 MBD4O95243 580 aa21.33■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.33■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 KIF2CQ99661 725 aa21.33■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.33■■□□□ 1.01
LTV1-201ENST00000367576 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.32■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 SOGA3Q5TF21 947 aa21.32■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 MXD3Q9BW11 206 aa21.32■■□□□ 1
LTV1-201ENST00000367576 ARMT1Q9H993 441 aa21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.8 ms