RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 DHRSXQ8N5I4 330 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 RPS4Y2Q8TD47 263 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 GGHQ92820 318 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 CYYR1Q96J86 154 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 RDH12Q96NR8 316 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 GPER1Q99527 375 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 TMEM133Q9H2Q1 129 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 GLS2Q9UI32 602 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 SESN1Q9Y6P5 492 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 A0A1W2PPK0 400 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 H0YJX3 145 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 DEGS1O15121 323 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 OGG1O15527 345 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 HTR3BO95264 441 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 CDK2P24941 298 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 LMO1P25800 156 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 DCKP27707 260 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 ERP29P30040 261 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 EFNB2P52799 333 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 SLC34A1Q06495 639 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 KRBOX4Q5JUW0 171 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 SAXO1Q8IYX7 474 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 LYG1Q8N1E2 194 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 OR4P4Q8NGL7 312 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 NDNFQ8TB73 568 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 TMEM106AQ96A25 262 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 MALSU1Q96EH3 234 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 CLEC7AQ9BXN2 247 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 ZNF702PQ9H963 129 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 ZNF286AQ9HBT8 521 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 FBLN5Q9UBX5 448 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 TCF19Q9Y242 345 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 A0A1W2PP11 408 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 ODAMA1E959 279 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 A6NDX4 124 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 VGLL3A8MV65 326 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 ALX3O95076 343 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 RBP4P02753 201 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 VSIG10L2P0DP72 767 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 DEFA6Q01524 100 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 ST3GAL4Q11206 333 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 AANATQ16613 207 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 TTC23Q5W5X9 447 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 C1QL4Q86Z23 238 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 ABHD12Q8N2K0 398 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 ZNF485Q8NCK3 441 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 GPR148Q8TDV2 347 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 GHSRQ92847 366 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 LEAP2Q969E1 77 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 TMEM80Q96HE8 168 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 OR5M11Q96RB7 305 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 ABCB10Q9NRK6 738 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 BABAM2Q9NXR7 383 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 ING4Q9UNL4 249 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 VWFP04275 2813 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 M0QZ24 198 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 TIMM23O14925 209 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 MYL12AP19105 171 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 NFYBP25208 207 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 CAPGP40121 348 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 GLP1RP43220 463 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 KIR2DS4P43632 304 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 MTNR1BP49286 362 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 BLCAPP62952 87 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 RSU1Q15404 277 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 LTC4SQ16873 150 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 CCDC58Q4VC31 144 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 DDI2Q5TDH0 399 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 ELP2Q6IA86 826 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
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