RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 NOL3O60936 208 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 MITFO75030 526 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 NXPH2O95156 264 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 AMY1AP04745 511 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 AMY2AP04746 511 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC159P0C7I6 412 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 MPZP25189 248 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 GABARAPL2P60520 117 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 CDC42P60953 191 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ISL1P61371 349 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF684Q5T5D7 378 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF773Q6PK81 442 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ETV3LQ6ZN32 361 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 COMMD2Q86X83 199 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF575Q86XF7 245 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 DTX3Q8N9I9 347 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 OR52N4Q8NGI2 321 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 OR13D1Q8NGV5 346 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 OR14K1Q8NGZ2 314 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 TEX12Q9BXU0 123 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 GABARAPL3Q9BY60 117 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 IL36RNQ9UBH0 155 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ENPP5Q9UJA9 477 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 LAMP5Q9UJQ1 280 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 PITPNC1Q9UKF7 332 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 SLC22A13Q9Y226 551 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 V9GYS6 101 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PPE2 198 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PR64 198 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PRV1 198 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 PTGES3LE9PB15 166 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 F2RL2O00254 374 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 DHRS3O75911 302 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 INMTO95050 263 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 RBP4P02753 201 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 LPLP06858 475 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 PF4V1P10720 104 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 PAICSP22234 425 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 CRHBPP24387 322 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 EDDM3BP56851 147 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ACTA2P62736 377 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ACTG2P63267 376 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ACTC1P68032 377 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ACTA1P68133 377 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ROM1Q03395 351 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 SLC35D3Q5M8T2 416 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 CLVS2Q5SYC1 327 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 UTF1Q5T230 341 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 DEGS2Q6QHC5 323 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 Q6ZSR3 168 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 C18orf65Q6ZTR6 163 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF573Q86YE8 665 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 OR4P4Q8NGL7 312 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 Q96MT0 163 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC90BQ9GZT6 254 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 CLN6Q9NWW5 311 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 PTTG2Q9NZH5 202 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 MTCH1Q9NZJ7 389 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 E9PQ18 207 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 H3BSH0 61 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 PEX14O75381 377 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 CHRM2P08172 466 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 OSMP13725 252 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 CRISP1P54107 249 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 OR12D2P58182 307 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 RPS7P62081 194 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 SLC35A2P78381 396 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 IL24Q13007 206 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 EDDM3AQ14507 147 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 UBE2V2Q15819 145 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ABCA11PQ4W5N1 156 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 MINOS1Q5TGZ0 78 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF679Q8IYX0 411 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ELMOD2Q8IZ81 293 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 OR8H2Q8N162 312 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 NDNFQ8TB73 568 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 SLAMF9Q96A28 289 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 SNX22Q96L94 193 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF714Q96N38 554 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 B9D2Q9BPU9 175 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 PRRG3Q9BZD7 231 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 PKIBQ9C010 78 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 CHST6Q9GZX3 395 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM133Q9H2Q1 129 aa5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms