RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511467.1

PTPN13-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, human

APPRIS P4 TSL 2 BASIC

Gene PTPN13, Length 8,076 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN13-209	ENST00000511467		H0Y980	276 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	CXorf1	O96002	111 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	CRISP2	P16562	243 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ID2	Q02363	134 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	C10orf128	Q5T292	105 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF511	Q8NB15	262 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	HS3ST1	O14792	307 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ADAP1	O75689	374 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	CTSF	Q9UBX1	484 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467		M0QYG6	137 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	CTDSP2	O14595	271 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	C1QA	P02745	245 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	PAX6	P26367	422 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	SHC1	P29353	583 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	SULT1A2	P50226	295 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	RELB	Q01201	579 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	RIG	Q13278	110 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	OPCML	Q14982	345 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467		H7BYZ3	331 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	AKR7A3	O95154	331 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	SLC37A1	P57057	533 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	KISS1	Q15726	138 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	BAP18	Q8IXM2	172 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	GPA33	Q99795	319 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	OR2T8	A6NH00	312 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	UPK2	O00526	184 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ICOSLG	O75144	302 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	HPX	P02790	462 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ALOX5AP	P20292	161 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	SLC6A1	P30531	599 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	DRD3	P35462	400 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	PIGP	P57054	158 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	GPR119	Q8TDV5	335 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	HES7	Q9BYE0	225 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467		Q9N2K0	584 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM202	A6NGA9	273 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	HLA-G	P17693	338 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	CCR2	P41597	374 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ASIP	P42127	132 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	NMNAT3	Q96T66	252 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	SOD3	P08294	240 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	OR4A8	P0C604	315 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ZP3	P21754	424 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	DESI1	Q6ICB0	168 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467		Q6ZNX1	250 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN13-209	ENST00000511467	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71

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