RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DGUOKQ16854 277 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP6V1FQ16864 119 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KLHL12Q53G59 568 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C11orf87Q6NUJ2 197 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZFP1Q6P2D0 407 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AGTRAPQ6RW13 159 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCIMPQ6UWF3 145 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM131AQ6UXB0 335 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SERPINA11Q86U17 422 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COMMD2Q86X83 199 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MMD2Q8IY49 270 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LGI3Q8N145 548 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NEIL2Q969S2 332 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMBIM1Q969X1 311 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SORCS2Q96PQ0 1159 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NODALQ96S42 347 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF446Q9NWS9 450 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLXNB1O43157 2135 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR2M5A3KFT3 312 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FTCDNL1E5RQL4 147 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UGT2B17O75795 530 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRT33AO76009 404 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C8orf88P0DMB2 117 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCGB1A1P11684 91 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FUT3P21217 361 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FUT6P51993 359 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLDN20P56880 219 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ESRRGP62508 458 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CRADDP78560 199 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PSG6Q00889 435 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CFHR3Q02985 330 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GAGE1Q13065 139 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPR50Q13585 617 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CEACAM7Q14002 265 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SAXO2Q658L1 398 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CREB3L2Q70SY1 520 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC35F2Q8IXU6 374 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CPNE9Q8IYJ1 553 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MUC15Q8N387 334 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DHRSXQ8N5I4 330 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR9Q2Q8NGE9 314 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR5L1Q8NGL2 311 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR6K3Q8NGY3 331 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR51A7Q8NH64 312 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TAAR8Q969N4 342 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TLCD1Q96CP7 247 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MS4A6EQ96DS6 147 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HBEGFQ99075 208 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMED9Q9BVK6 235 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OSBPL11Q9BXB4 747 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPA2Q9H2U2 334 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNF121Q9H920 327 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RHOFQ9HBH0 211 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ISYNA1Q9NPH2 558 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TREM2Q9NZC2 230 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RYR1P21817 5038 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC22A23A1A5C7 686 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 METTL15A6NJ78 407 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RFPL4AA6NLU0 287 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM90A26D6RGX4 464 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 G3V4G9 280 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF195O14628 629 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IMPA2O14732 288 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARPC5O15511 151 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPINT2O43291 252 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FGF16O43320 207 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZIC3O60481 467 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ICOSLGO75144 302 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NXPH3O95157 252 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 APOC2P02655 101 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HCKP08631 526 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MPC1LP0DKB6 136 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CELP19835 753 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 S100PP25815 95 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DUTP33316 252 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SFTPDP35247 375 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CRYBA4P53673 196 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109 ms