RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 COQ7Q99807 217 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRK-209ENST00000415046 NEURL2Q9BR09 285 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRK-209ENST00000415046 ABHD6Q9BV23 337 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRK-209ENST00000415046 OR2J1Q9GZK6 312 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF442Q9H7R0 627 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRK-209ENST00000415046 MARCH7Q9H992 704 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRK-209ENST00000415046 ELOVL3Q9HB03 270 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRK-209ENST00000415046 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRK-209ENST00000415046 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRK-209ENST00000415046 HAO2Q9NYQ3 351 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRK-209ENST00000415046 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRK-209ENST00000415046 LAMP5Q9UJQ1 280 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRK-209ENST00000415046 IKZF2Q9UKS7 526 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRK-209ENST00000415046 STARD10Q9Y365 291 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRK-209ENST00000415046 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 A0A0U1RQK1 487 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF320A2RRD8 509 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 PRR32B1ATL7 298 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 LYNX1G3V0Z9 82 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 M0R135 149 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 ENTPD6O75354 484 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 CLIC3O95833 236 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 LYNP07948 512 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 FAM106CPP0CH98 169 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 LYNX1P0DP58 116 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF250P15622 560 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 RGS6P49758 472 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 PPOXP50336 477 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 CCL8P80075 99 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 RPL24P83731 157 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 IL5RAQ01344 420 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 ECH1Q13011 328 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 CLEC12BQ2HXU8 276 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 SNAI3Q3KNW1 292 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 TMEM255AQ5JRV8 349 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 SLC35D3Q5M8T2 416 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 AADACL4Q5VUY2 407 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 NXNL2Q5VZ03 156 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 OR2T2Q6IF00 324 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 C11orf88Q6PI97 169 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 SLC16A9Q7RTY1 509 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 GID4Q8IVV7 300 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 TIGD4Q8IY51 512 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 DHRSXQ8N5I4 330 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF525Q8N782 197 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 OR10H4Q8NGA5 316 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 OR8J1Q8NGP2 316 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 OR5R1Q8NH85 324 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 OTOSQ8NHW6 89 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 CMBLQ96DG6 245 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF799Q96GE5 643 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 HARBI1Q96MB7 349 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 ASCL2Q99929 193 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 FOXC2Q99958 501 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 APOL4Q9BPW4 351 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 YIPF3Q9GZM5 350 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 DCLRE1BQ9H816 532 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 ADGRL4Q9HBW9 690 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 ATPIF1Q9UII2 106 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 COPS3Q9UNS2 423 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 KCNK7Q9Y2U2 307 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 COL6A5A8TX70 2615 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 GGT3PA6NGU5 568 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 H3BSH0 61 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 H7C417 338 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 DLGAP1O14490 977 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 VCYO14598 125 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 RPP14O95059 124 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 IGHV3-13P01766 116 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 SBK2P0C263 348 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 ALOX5APP20292 161 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 HTR1FP30939 366 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 RBMXP38159 391 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 OPRL1P41146 370 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 MAGEB1P43366 347 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 EFNA4P52798 201 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 AQP4P55087 323 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 CXCR4P61073 352 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 GNB1P62873 340 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 GRB2P62993 217 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF92Q03936 586 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-209ENST00000415046 SLC34A1Q06495 639 aa3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.1 ms