RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 SOX6P35712 828 aa9.72□□□□□ -0.85
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CAPNS1-209ENST00000590049 PRSS12P56730 875 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 KRTAP10-3P60369 221 aa9.72□□□□□ -0.85
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CAPNS1-209ENST00000590049 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-209ENST00000590049 Q6ZSR3 168 aa9.72□□□□□ -0.85
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CAPNS1-209ENST00000590049 ATP1B3P54709 279 aa9.69□□□□□ -0.86
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CAPNS1-209ENST00000590049 DGUOKQ16854 277 aa9.69□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa9.69□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 JAGN1Q8N5M9 183 aa9.69□□□□□ -0.86
CAPNS1-209ENST00000590049 SPERTQ8NA61 448 aa9.69□□□□□ -0.86
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