RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACTR3BQ9P1U1 418 aa3.68□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD300AQ9UGN4 299 aa3.68□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNG2Q9UJ96 466 aa3.68□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 B9D1Q9UPM9 204 aa3.68□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa3.68□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPIAL4AQ9Y536 164 aa3.68□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPTNQ9Y639 398 aa3.68□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa3.68□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1B0GW55 424 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 DHRS12A0PJE2 317 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 HTR3EA5X5Y0 456 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIIAD1A6NNX1 92 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEACAM18A8MTB9 384 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 BHLHE40O14503 412 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SELENOFO60613 162 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 E2F6O75461 281 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 KDM4BO94953 1096 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TXNDC12O95881 172 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM107AO95990 144 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 CST1P01037 141 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACSM4P0C7M7 580 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 DUX4L2P0CJ85 424 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 DUX4L3P0CJ86 424 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 DUX4L4P0CJ87 422 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 DUX4L5P0CJ88 424 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 DUX4L6P0CJ89 424 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 COX5BP10606 129 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 MMP9P14780 707 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF823P16415 610 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF3P17036 446 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPI1P17947 270 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 KITLGP21583 273 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCMT1P22061 227 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 CALB2P22676 271 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 CA6P23280 308 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSD11B1P28845 292 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 GGT2P36268 569 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFNGR2P38484 337 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGEA2P43356 314 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 CX3CR1P49238 355 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM33P57088 247 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMIM11AP58511 58 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 LSM6P62312 80 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSNK2BP67870 215 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 MS4A2Q01362 244 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF92Q03936 586 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC3A1Q07837 685 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAF13Q15543 124 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR8G1Q15617 311 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 MPPED2Q15777 294 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 MOGQ16653 247 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHL12Q53G59 568 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2T5Q6IEZ7 315 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACSM5Q6NUN0 579 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAA40Q86UY6 237 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATA24Q86W54 205 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 DHFR2Q86XF0 187 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPICQ8N5J4 248 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 RFLNBQ8N5W9 214 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2T33Q8NG76 320 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR56B2PQ8NGI1 322 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4C15Q8NGM1 316 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2T29Q8NH02 315 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATA3Q8NHX4 192 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPTSSAQ969W0 71 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLCO4A1Q96BD0 722 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 AMELYQ99218 206 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 COQ7Q99807 217 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM15Q9C019 465 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 MARCH7Q9H992 704 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ESM1Q9NQ30 184 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 MMP26Q9NRE1 261 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFRSF19Q9NS68 423 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 CENPMQ9NSP4 180 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 DUX4Q9UBX2 424 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR5V1Q9UGF6 321 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa3.67□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 WNK1Q9H4A3 2382 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 GGT3PA6NGU5 568 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 IQCF6A8MYZ5 107 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF878C9JN71 531 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM90A26D6RGX4 464 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAPPC2LH3BP13 241 aa3.66□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM178BH3BS89 294 aa3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 663.9 ms