RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 DUX4L3P0CJ86 424 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 DUX4L4P0CJ87 422 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 DUX4L5P0CJ88 424 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 DUX4L6P0CJ89 424 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 DUX4L7P0CJ90 424 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 MMP9P14780 707 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 CFHR2P36980 270 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 RELBQ01201 579 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 OR8B8Q15620 311 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 CDONQ4KMG0 1287 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 OR2G6Q5TZ20 316 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 GPR157Q5UAW9 335 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 XAF1Q6GPH4 301 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 TREML4Q6UXN2 200 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 KCTD8Q6ZWB6 473 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 KIR3DL3Q8N743 410 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 ZNF485Q8NCK3 441 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 OR56B2PQ8NGI1 322 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 OR52N1Q8NH53 320 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 THEM6Q8WUY1 208 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 RNF133Q8WVZ7 376 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 ASB17Q8WXJ9 295 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 SPTSSAQ969W0 71 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 ERGIC1Q969X5 290 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 OR5M11Q96RB7 305 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 CHIAQ9BZP6 476 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 PRDM13Q9H4Q3 707 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 ACOT13Q9NPJ3 140 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 CENPMQ9NSP4 180 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 DUX4Q9UBX2 424 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 ERGIC3Q9Y282 383 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PRAME-212ENST00000485532 TGP01266 2768 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 A6NLC8 198 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 POM121CA8CG34 1229 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 SRRM5B3KS81 715 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 ZNF879B4DU55 563 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 PSMD9O00233 223 aa10.45□□□□□ -0.74
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PRAME-212ENST00000485532 GMDSO60547 372 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 TOX4O94842 621 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 TFAP2AP05549 437 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
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PRAME-212ENST00000485532 NEDD8Q15843 81 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 TP53I3Q53FA7 332 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 DRAM2Q6UX65 266 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 Q6YL49 198 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 WDR86Q86TI4 376 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 FAM90A1Q86YD7 464 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 PDZD9Q8IXQ8 264 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 GCSAMQ8N6F7 178 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 SLAMF6Q96DU3 332 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 OR8B4Q96RC9 309 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 C1RLQ9NZP8 487 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 SCOCQ9UIL1 159 aa10.45□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 OOEPA6NGQ2 149 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 METTL15A6NJ78 407 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 INMTO95050 263 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 MELTFP08582 738 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 OPRL1P41146 370 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 WNT4P56705 351 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP10-3P60369 221 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 ARF6P62330 175 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 ACTA2P62736 377 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 ACTG2P63267 376 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 DEFA6Q01524 100 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 EGR3Q06889 387 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 UBE2UQ5VVX9 321 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 BTN2A1Q7KYR7 527 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 SYS1Q8N2H4 156 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 LHX4Q969G2 390 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 MUL1Q969V5 352 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 SEH1LQ96EE3 360 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 C4orf36Q96KX1 117 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 WDFY2Q96P53 400 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 MND1Q9BWT6 205 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 SLC22A4Q9H015 551 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 SIRPDQ9H106 197 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 SLITRK2Q9H156 845 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 GNG8Q9UK08 70 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 CMYA5Q8N3K9 4069 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 E9PI62 339 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 J3QLW9 94 aa10.43□□□□□ -0.74
PRAME-212ENST00000485532 P2RY10O00398 339 aa10.43□□□□□ -0.74
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